RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPATQ14207 1427 aa27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 TET3O43151 1660 aa27.59■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.58■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.58■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
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CCNDBP1-205ENST00000564630 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.57■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVK-7P63135 1459 aa27.56■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.55■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.55■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.55■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.55■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNRQ92752 1358 aa27.54■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.53■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.53■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 E9PCH4 1651 aa27.53■■■□□ 2
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA2P54652 639 aa27.5■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.5■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.47■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNMO15061 1565 aa27.45■■□□□ 1.99
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLA2R1Q13018 1463 aa27.45■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOS1P29475 1434 aa27.42■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAMC1P11047 1609 aa27.41■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.4■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRP1Q9C000 1473 aa27.39■■□□□ 1.98
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIK3C2BO00750 1634 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMC1Q8TDI8 760 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDI1Q13907 227 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 RALBP1Q15311 655 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGL3Q3MIN7 710 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUDCQ9Y266 331 aa27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.29■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRTO14522 1441 aa27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 STRCQ7RTU9 1775 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPM2O94759 1503 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADGRB3O60242 1522 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLTCL1P53675 1640 aa27.24■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 TESK2Q96S53 571 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.18■■□□□ 1.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRP13Q86W25 1043 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLIT1O75093 1534 aa27.14■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF1BO60333 1816 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 LTKP29376 864 aa27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQGAP1P46940 1657 aa27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMF1P82094 1093 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFYVE9O95405 1425 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 PANK3Q9H999 370 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 EID1Q9Y6B2 187 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 MED14O60244 1454 aa27.01■■□□□ 1.92
CCNDBP1-205ENST00000564630 INSRP06213 1382 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE3BQ13370 1112 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAC3Q96MF2 364 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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