RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.94□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 APLP1P51693 650 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 IL21Q9HBE4 155 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 FAM161AQ3B820 660 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 MTRQ99707 1265 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.89□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 FECHP22830 423 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.87□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.87□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 CFHP08603 1231 aa8.84□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 ZNF516Q92618 1163 aa8.84□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RRN3-204ENST00000561685 ZPR1O75312 459 aa8.83□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 COPS2P61201 443 aa8.83□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 SLC10A3P09131 477 aa8.82□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 MAP2K5Q13163 448 aa8.82□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 GGCXP38435 758 aa8.81□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 SULF1Q8IWU6 871 aa8.81□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.8□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.8□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.78□□□□□ -1
RRN3-204ENST00000561685 IRF6O14896 467 aa8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 NR1I2O75469 434 aa8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 RDH13Q8NBN7 331 aa8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 PHOX2BQ99453 314 aa8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.76□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.76□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 NLRP7Q8WX94 980 aa8.74□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 TLL1O43897 1013 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 ADH1BP00325 375 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 GCGRP47871 477 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 CCDC102AQ96A19 550 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-204ENST00000561685 ATP6V1AP38606 617 aa8.71□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.71□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 FUT2Q10981 343 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 LAPTM4AQ15012 233 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 MORN1Q5T089 497 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 RNF223E7ERA6 249 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 CD46P15529 392 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 CLCN1P35523 988 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 S1PR4O95977 384 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 SPSB2Q99619 263 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 ZMYND10O75800 440 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 BARGINQ6ZT62 677 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-204ENST00000561685 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 USP46P62068 366 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 KDM4AO75164 1064 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 THAP11Q96EK4 314 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 Q3C1V9 767 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 SLC19A1P41440 591 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 GFRA3O60609 400 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 AMHR2Q16671 573 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 BRICD5Q6PL45 260 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZNB5 142 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 MSS51Q4VC12 460 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-204ENST00000561685 SPRYD7Q5W111 196 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 HOXA2O43364 376 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 RPIAP49247 311 aa8.54□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.54□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.54□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 AK7Q96M32 723 aa8.54□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PRR20EP86478 221 aa8.53□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PRR20CP86479 221 aa8.53□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PRR20DP86480 221 aa8.53□□□□□ -1.04
RRN3-204ENST00000561685 PRR20BP86481 221 aa8.53□□□□□ -1.04
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