RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 CUX1P39880 1505 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 CERKQ8TCT0 537 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 COL9A1P20849 921 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 NBR1Q14596 966 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTS12P58397 1594 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 KIF21BO75037 1637 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 PROX2Q3B8N5 592 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 PLCB2Q00722 1185 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 HCSTQ9UBK5 93 aa8.57□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K7O43318 606 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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TMOD3-210ENST00000561408 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA2P54652 639 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.55□□□□□ -1.04
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TMOD3-210ENST00000561408 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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TMOD3-210ENST00000561408 GLI2P10070 1586 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 PTPRMP28827 1452 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-210ENST00000561408 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.53□□□□□ -1.04
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TMOD3-210ENST00000561408 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 WNT2BQ93097 391 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 ASXL2Q76L83 1435 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.5□□□□□ -1.05
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TMOD3-210ENST00000561408 PTPN5P54829 565 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.49□□□□□ -1.05
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TMOD3-210ENST00000561408 P3H3Q8IVL6 736 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 ABCC2Q92887 1545 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-210ENST00000561408 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.46□□□□□ -1.06
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TMOD3-210ENST00000561408 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.45□□□□□ -1.06
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TMOD3-210ENST00000561408 PRSS12P56730 875 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 BCAMP50895 628 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 PTPRGP23470 1445 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 SMAPO00193 183 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-210ENST00000561408 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 PNMA3Q9UL41 463 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF26B4DH59 902 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 SEMA3EO15041 775 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 TATDN2Q93075 761 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 STRCQ7RTU9 1775 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 C3orf80F5H4A9 247 aa8.37□□□□□ -1.07
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TMOD3-210ENST00000561408 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
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TMOD3-210ENST00000561408 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 CD109Q6YHK3 1445 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.34□□□□□ -1.08
TMOD3-210ENST00000561408 NUTM2FA1L443 756 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-210ENST00000561408 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-210ENST00000561408 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-210ENST00000561408 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.33□□□□□ -1.08
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