RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 LRP6O75581 1613 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 C14orf37Q86TY3 774 aa30.39■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.39■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 NOS1P29475 1434 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 DAPK1P53355 1430 aa30.34■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.33■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 RXRBP28702 533 aa30.33■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.32■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.31■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.3■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.3■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.29■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 ATF3P18847 181 aa30.28■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 ZFYVE9O95405 1425 aa30.28■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.27■■■□□ 2.44
SEMA4B-211ENST00000559322 SHPRHQ149N8 1683 aa30.26■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 TBX22Q9Y458 520 aa30.25■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.24■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
SEMA4B-211ENST00000559322 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.19■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.17■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 AFF2P51816 1311 aa30.16■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 APLP2Q06481 763 aa30.15■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 BRINP3Q76B58 766 aa30.15■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.14■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SEMA4B-211ENST00000559322 PIK3R4Q99570 1358 aa30.13■■■□□ 2.41
SEMA4B-211ENST00000559322 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.12■■■□□ 2.41
SEMA4B-211ENST00000559322 DIP2AQ14689 1571 aa30.11■■■□□ 2.41
SEMA4B-211ENST00000559322 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.07■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.06■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 C8orf37Q96NL8 207 aa30.06■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRL2O95490 1459 aa30.06■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.05■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 TRPM2O94759 1503 aa30.05■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 RGS12O14924 1447 aa30.05■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.04■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.04■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 DCCP43146 1447 aa30.02■■■□□ 2.4
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRUQ92729 1446 aa29.98■■■□□ 2.39
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SEMA4B-211ENST00000559322 MST1RQ04912 1400 aa29.96■■■□□ 2.39
SEMA4B-211ENST00000559322 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.95■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 NGLY1Q96IV0 654 aa29.94■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.92■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 FOXD1Q16676 465 aa29.92■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.91■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 UNC13BO14795 1591 aa29.91■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 E9PCH4 1651 aa29.9■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 ADAMTS2O95450 1211 aa29.89■■■□□ 2.38
SEMA4B-211ENST00000559322 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SEMA4B-211ENST00000559322 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.86■■■□□ 2.37
SEMA4B-211ENST00000559322 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.84■■■□□ 2.37
SEMA4B-211ENST00000559322 USP21Q9UK80 565 aa29.82■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.81■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.8■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.8■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 METP08581 1390 aa29.79■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.78■■■□□ 2.36
SEMA4B-211ENST00000559322 NUP155O75694 1391 aa29.74■■■□□ 2.35
SEMA4B-211ENST00000559322 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.73■■■□□ 2.35
SEMA4B-211ENST00000559322 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.72■■■□□ 2.35
SEMA4B-211ENST00000559322 PTCH1Q13635 1447 aa29.7■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC125Q86Z20 511 aa29.68■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 ATRNO75882 1429 aa29.66■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 ORAI2Q96SN7 254 aa29.66■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 ROCK1Q13464 1354 aa29.65■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 LAMC1P11047 1609 aa29.64■■■□□ 2.34
SEMA4B-211ENST00000559322 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.6■■■□□ 2.33
SEMA4B-211ENST00000559322 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.56■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.53■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.53■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 ITGAEP38570 1179 aa29.52■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 EP400Q96L91 3159 aa29.52■■■□□ 2.32
SEMA4B-211ENST00000559322 MYOM2P54296 1465 aa29.52■■■□□ 2.32
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