RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 FECHP22830 423 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 WBP1LQ9NX94 342 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-205ENST00000558714 IRF6O14896 467 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 OATP04181 439 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 DNAJB2P25686 324 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 PPP4CP60510 307 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 AMHR2Q16671 573 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 C14orf37Q86TY3 774 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 NECTIN2Q92692 538 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 SLC4A3P48751 1232 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 IFFO2Q5TF58 517 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 SLF2Q8IX21 1173 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 IL27Q8NEV9 243 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 RCCD1A6NED2 376 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 FAM161AQ3B820 660 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 FAM117AQ9C073 453 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 RNF40O75150 1001 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-205ENST00000558714 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 PRR14Q9BWN1 585 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 KCNC4Q03721 635 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 APLP1P51693 650 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 A0A0G2JS52 829 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 MS4A1P11836 297 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 PHOX2BQ99453 314 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 IL21Q9HBE4 155 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 RGS20O76081 388 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 MTRQ99707 1265 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-205ENST00000558714 SLC10A3P09131 477 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 SULF1Q8IWU6 871 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 CFHP08603 1231 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 CLCN1P35523 988 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 NLRP7Q8WX94 980 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 GOPCQ9HD26 462 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 ZPR1O75312 459 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 COPS2P61201 443 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 RDH13Q8NBN7 331 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF516Q92618 1163 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 GCGRP47871 477 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-205ENST00000558714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 NR1I2O75469 434 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 CD46P15529 392 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 ARXQ96QS3 562 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 GGCXP38435 758 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 ATP6V1AP38606 617 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 FUT2Q10981 343 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 MORN1Q5T089 497 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 ZMYND15Q9H091 742 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 ADH1BP00325 375 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 USP46P62068 366 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 FLIIQ13045 1269 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 TLL1O43897 1013 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 KDM4AO75164 1064 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 MCM6Q14566 821 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-205ENST00000558714 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-205ENST00000558714 THAP11Q96EK4 314 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-205ENST00000558714 SPSB2Q99619 263 aa5.89□□□□□ -1.47
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