RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 GGT6Q6P531 493 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM260-216ENST00000557657 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM260-216ENST00000557657 PLIN1O60240 522 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM260-216ENST00000557657 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
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TMEM260-216ENST00000557657 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TMEM260-216ENST00000557657 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM260-216ENST00000557657 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TMEM260-216ENST00000557657 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TMEM260-216ENST00000557657 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TMEM260-216ENST00000557657 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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