RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHD1O14646 1710 aa27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 SHROOM2Q13796 1616 aa27■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLCH2O75038 1416 aa26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 PIK3C2GO75747 1445 aa26.98■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP152O94986 1710 aa26.97■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRPM2O94759 1503 aa26.97■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.97■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC1P33527 1531 aa26.96■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.96■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYOM1P52179 1685 aa26.95■■□□□ 1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.95■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLFN5Q08AF3 891 aa26.95■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 STAC3Q96MF2 364 aa26.94■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.93■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.92■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM161AQ3B820 660 aa26.92■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLTCL1P53675 1640 aa26.91■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.91■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTPRTO14522 1441 aa26.89■■□□□ 1.9
RPS6KL1-216ENST00000557413 C8orf34Q49A92 452 aa26.89■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 APAF1O14727 1248 aa26.86■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC4A3P48751 1232 aa26.86■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 DEPDC5O75140 1603 aa26.83■■□□□ 1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGS3P49796 1198 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 TET3O43151 1660 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 AFAP1Q8N556 730 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 IL27Q8NEV9 243 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 NFKBIBQ15653 356 aa26.81■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCAR3O75815 825 aa26.8■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 E9PSI1 815 aa26.79■■□□□ 1.88
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERVK-7P63135 1459 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC24A1O60721 1099 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 KANK1Q14678 1352 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 GSE1Q14687 1217 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 NGEFQ8N5V2 710 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.73■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.72■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCA6Q8N139 1617 aa26.72■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.72■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.71■■□□□ 1.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYOM2P54296 1465 aa26.7■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 IGHDP01880 384 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP7AQ04656 1500 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDE3AQ14432 1141 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.67■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF3BO15066 747 aa26.67■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF1BO60333 1816 aa26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 WWC1Q8IX03 1113 aa26.65■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.65■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFT172Q9UG01 1749 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.61■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 PANK1Q8TE04 598 aa26.61■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 COG6Q9Y2V7 657 aa26.61■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.6■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 FANCAO15360 1455 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 MROH2AA6NES4 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 SHPRHQ149N8 1683 aa26.57■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.57■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.57■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP19O94966 1318 aa26.57■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.56■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEUROD2Q15784 382 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 MORC1Q86VD1 984 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 RUNDC1Q96C34 613 aa26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms