RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.3□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRPM2O94759 1503 aa10.29□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 FANCAO15360 1455 aa10.29□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 DEPDC5O75140 1603 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.27□□□□□ -0.76
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF3BO15066 747 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 POLA2Q14181 598 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 TET3O43151 1660 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATP7AQ04656 1500 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 OSCARQ8IYS5 282 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 ASXL2Q76L83 1435 aa10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRL1O94910 1474 aa10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.24□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 MADDQ8WXG6 1647 aa10.23□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.23□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.23□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.23□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 CEP152O94986 1710 aa10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP2R1AP30153 589 aa10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 NGEFQ8N5V2 710 aa10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYOM2P54296 1465 aa10.21□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 IQGAP1P46940 1657 aa10.21□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCB7O75027 752 aa10.2□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 CLTCL1P53675 1640 aa10.2□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.2□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.2□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.19□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.19□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 PIK3C2GO75747 1445 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 CD109Q6YHK3 1445 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYNMO15061 1565 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 MS4A1P11836 297 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 DSG3P32926 999 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF1BO60333 1816 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF521Q96K83 1311 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA2Q08379 1002 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 NEO1Q92859 1461 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ERVK-7P63135 1459 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLFN5Q08AF3 891 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 GGT6Q6P531 493 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOS1P29475 1434 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 NPATQ14207 1427 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRB3O60242 1522 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 IFT172Q9UG01 1749 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZFYVE9O95405 1425 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCA6Q8N139 1617 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBE2CP1-201ENST00000557130 E9PSI1 815 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms