RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP1CC-208ENST00000551676 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.11■■■■□ 3.37
PPP1CC-208ENST00000551676 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
PPP1CC-208ENST00000551676 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
PPP1CC-208ENST00000551676 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.07■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC7Q96M83 1385 aa36.05■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 ZFYVE9O95405 1425 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.02■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 MIER1Q8N108 512 aa36.02■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 PIK3C2GO75747 1445 aa36.01■■■■□ 3.36
PPP1CC-208ENST00000551676 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 TNRQ92752 1358 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.98■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.97■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 IQGAP1P46940 1657 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP1CC-208ENST00000551676 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.34
PPP1CC-208ENST00000551676 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP1CC-208ENST00000551676 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.92■■■■□ 3.34
PPP1CC-208ENST00000551676 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.9■■■■□ 3.34
PPP1CC-208ENST00000551676 C3P01024 1663 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 TESK2Q96S53 571 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 ADGRB1O14514 1584 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 NLRP1Q9C000 1473 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP1CC-208ENST00000551676 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
PPP1CC-208ENST00000551676 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP1CC-208ENST00000551676 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP1CC-208ENST00000551676 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.74■■■■□ 3.31
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-208ENST00000551676 TMF1P82094 1093 aa35.71■■■■□ 3.31
PPP1CC-208ENST00000551676 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP1CC-208ENST00000551676 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 ANP32CO43423 234 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC24A1O60721 1099 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 ALKQ9UM73 1620 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP1CC-208ENST00000551676 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-208ENST00000551676 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP1CC-208ENST00000551676 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-208ENST00000551676 CDCA8Q53HL2 280 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 PTPRMP28827 1452 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 SLIT1O75093 1534 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 CCER2I3L3R5 266 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
PPP1CC-208ENST00000551676 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 LTKP29376 864 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
PPP1CC-208ENST00000551676 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 STK26Q9P289 416 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 EID1Q9Y6B2 187 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 DLC1Q96QB1 1528 aa35.42■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCC11Q96J66 1382 aa35.41■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.4■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 METP08581 1390 aa35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-208ENST00000551676 MED14O60244 1454 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 PANK3Q9H999 370 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 PRAM1Q96QH2 718 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-208ENST00000551676 MYOM1P52179 1685 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 SIRT1Q96EB6 747 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 BCANQ96GW7 911 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 TECPR2O15040 1411 aa35.31■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 EVC2Q86UK5 1308 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 POGKQ9P215 609 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 TBX22Q9Y458 520 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.25■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 DIP2AQ14689 1571 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 CPS1P31327 1500 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 RALBP1Q15311 655 aa35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-208ENST00000551676 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.19■■■■□ 3.22
PPP1CC-208ENST00000551676 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms