RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXD1Q16676 465 aa16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATF3P18847 181 aa16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHPRHQ149N8 1683 aa16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NWD1Q149M9 1564 aa16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRINP3Q76B58 766 aa16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS2O95450 1211 aa16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EP400Q96L91 3159 aa16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NGLY1Q96IV0 654 aa16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIP2AQ14689 1571 aa16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KANK1Q14678 1352 aa16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF15Q9NS87 1388 aa16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP21Q9UK80 565 aa16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRB3O60242 1522 aa16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX22Q9Y458 520 aa16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.28■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.27■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC125Q86Z20 511 aa16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFYVE9O95405 1425 aa16.26■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOS1P29475 1434 aa16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERBINQ96RT1 1412 aa16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.21■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MST1RQ04912 1400 aa16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRUQ92729 1446 aa16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATRNO75882 1429 aa16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC5O15440 1437 aa16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3R4Q99570 1358 aa16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCCP43146 1447 aa16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.13■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPM2O94759 1503 aa16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP5O75197 1615 aa16.12■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HRCP23327 699 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORAI2Q96SN7 254 aa16.11■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTCH1Q13635 1447 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.1■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YY1P25490 414 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAPK1P53355 1430 aa16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.06■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METP08581 1390 aa16.05■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNC13BO14795 1591 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.02■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAG6P46379 1132 aa16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYOM2P54296 1465 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLI3P10071 1580 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JS52 829 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHG5O94827 1062 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms