RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 ERVK-7P63135 1459 aa16.4■□□□□ 0.22
USP17L3-201ENST00000530484 IQGAP1P46940 1657 aa16.4■□□□□ 0.22
USP17L3-201ENST00000530484 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.38■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.38■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.36■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 IDI1Q13907 227 aa16.35■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.35■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.35■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 ANP32CO43423 234 aa16.34■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 PIK3C2GO75747 1445 aa16.34■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.34■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.33■□□□□ 0.21
USP17L3-201ENST00000530484 MLECQ14165 292 aa16.33■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 ZFYVE9O95405 1425 aa16.32■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 TESK2Q96S53 571 aa16.3■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 ZMYM3Q14202 1370 aa16.3■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 CCER2I3L3R5 266 aa16.3■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
USP17L3-201ENST00000530484 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.29■□□□□ 0.2
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USP17L3-201ENST00000530484 ADGRB1O14514 1584 aa16.27■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.26■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 TMF1P82094 1093 aa16.25■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.24■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.24■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 SLC24A1O60721 1099 aa16.23■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.22■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.22■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 TNRQ92752 1358 aa16.21■□□□□ 0.19
USP17L3-201ENST00000530484 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.21■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.21■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 CDCA8Q53HL2 280 aa16.19■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 C3P01024 1663 aa16.19■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.17■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 NLRP1Q9C000 1473 aa16.17■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.17■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.16■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.16■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 ALKQ9UM73 1620 aa16.15■□□□□ 0.18
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.14■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 MYOM1P52179 1685 aa16.13■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.13■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.1■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.09■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP17L3-201ENST00000530484 PANK3Q9H999 370 aa16.08■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.08■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 PTPRMP28827 1452 aa16.07■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 RALBP1Q15311 655 aa16.07■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 DLC1Q96QB1 1528 aa16.06■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 SLIT1O75093 1534 aa16.05■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.05■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.04■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 MRS2Q9HD23 443 aa16.04■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.03■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC184Q52MB2 194 aa16.03■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 EVC2Q86UK5 1308 aa16.02■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 STK26Q9P289 416 aa16.02■□□□□ 0.16
USP17L3-201ENST00000530484 ABCC11Q96J66 1382 aa16.02■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.02■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.02■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.01■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 KNSTRNQ9Y448 316 aa16■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 PRAM1Q96QH2 718 aa15.99■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 TECPR2O15040 1411 aa15.99■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 METP08581 1390 aa15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 POGKQ9P215 609 aa15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 EID1Q9Y6B2 187 aa15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 MED14O60244 1454 aa15.98■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 CPS1P31327 1500 aa15.97■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 LTKP29376 864 aa15.97■□□□□ 0.15
USP17L3-201ENST00000530484 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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