RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527026.1

PTPRJ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJ-204ENST00000527026 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRJ-204ENST00000527026 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRJ-204ENST00000527026 PTPRTO14522 1441 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRJ-204ENST00000527026 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
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PTPRJ-204ENST00000527026 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRJ-204ENST00000527026 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
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