RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.96■■□□□ 1.43
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TSNARE1-204ENST00000519651 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-204ENST00000519651 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-204ENST00000519651 IQGAP1P46940 1657 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-204ENST00000519651 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.93■■□□□ 1.42
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TSNARE1-204ENST00000519651 IDI1Q13907 227 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-204ENST00000519651 IFT172Q9UG01 1749 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.92■■□□□ 1.42
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TSNARE1-204ENST00000519651 CDCA8Q53HL2 280 aa23.89■■□□□ 1.41
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TSNARE1-204ENST00000519651 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.77■■□□□ 1.4
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TSNARE1-204ENST00000519651 ERVK-7P63135 1459 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-204ENST00000519651 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.76■■□□□ 1.39
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TSNARE1-204ENST00000519651 NLRP13Q86W25 1043 aa23.73■■□□□ 1.39
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TSNARE1-204ENST00000519651 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.58■■□□□ 1.37
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TSNARE1-204ENST00000519651 BCANQ96GW7 911 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-204ENST00000519651 CABP2Q9NPB3 220 aa23.49■■□□□ 1.35
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TSNARE1-204ENST00000519651 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-204ENST00000519651 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-204ENST00000519651 PTPRMP28827 1452 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-204ENST00000519651 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 NUDCQ9Y266 331 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.42■■□□□ 1.34
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