RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510721.1

PAPD4-213, Transcript of Poly(A) RNA polymerase GLD2, human

TSL 2

Gene PAPD4, Length 522 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPD4-213	ENST00000510721	ZMYND10	O75800	440 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	PTPN5	P54829	565 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	LCE2B	O14633	110 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	SLC4A3	P48751	1232 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	BCAM	P50895	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	PPP4C	P60510	307 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPD4-213	ENST00000510721	LAPTM4A	Q15012	233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	SLF2	Q8IX21	1173 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	NECTIN2	Q92692	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	CCDC102A	Q96A19	550 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	RNF40	O75150	1001 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	WBP1L	Q9NX94	342 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	AK7	Q96M32	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPD4-213	ENST00000510721	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	CLCN1	P35523	988 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	SLC10A3	P09131	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	AMHR2	Q16671	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	TRIM66	O15016	1216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	APLP1	P51693	650 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	CFH	P08603	1231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	CD46	P15529	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	GCGR	P47871	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	KCNC4	Q03721	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	PDE4D	Q08499	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	MTR	Q99707	1265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-213	ENST00000510721	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	GFRA3	O60609	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	KDM4A	O75164	1064 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	NR1I2	O75469	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	COPS2	P61201	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	FUT2	Q10981	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	ZPR1	O75312	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	USP46	P62068	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	MS4A1	P11836	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	MORN1	Q5T089	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	HOXA2	O43364	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721		Q3C1V9	767 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPD4-213	ENST00000510721	ADH1B	P00325	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	GGCX	P38435	758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	SPSB2	Q99619	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	TLL1	O43897	1013 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	FDX1	P10109	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPD4-213	ENST00000510721	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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