RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.13□□□□□ -0.47
PDE4D-217ENST00000509355 NECTIN2Q92692 538 aa12.12□□□□□ -0.47
PDE4D-217ENST00000509355 RGS20O76081 388 aa12.09□□□□□ -0.47
PDE4D-217ENST00000509355 MTRQ99707 1265 aa12.09□□□□□ -0.47
PDE4D-217ENST00000509355 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
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PDE4D-217ENST00000509355 PHOX2BQ99453 314 aa12.07□□□□□ -0.48
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC4A3P48751 1232 aa12.05□□□□□ -0.48
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PDE4D-217ENST00000509355 CD46P15529 392 aa11.84□□□□□ -0.51
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PDE4D-217ENST00000509355 FUT2Q10981 343 aa11.83□□□□□ -0.52
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PDE4D-217ENST00000509355 SPSB2Q99619 263 aa11.74□□□□□ -0.53
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PDE4D-217ENST00000509355 KDM4AO75164 1064 aa11.71□□□□□ -0.53
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PDE4D-217ENST00000509355 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 MMP16P51512 607 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-217ENST00000509355 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
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