RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHG5O94827 1062 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MPNDQ8N594 471 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.13■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.12■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MRE11P49959 708 aa15.12■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLCB2Q00722 1185 aa15.12■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.12■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PREX2Q70Z35 1606 aa15.11■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.11■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.11■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.1■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.1■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.1■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ATP10BO94823 1461 aa15.09■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.09■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.09■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.08■□□□□ 0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.08■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 GBP4Q96PP9 640 aa15.07■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 CLCN1P35523 988 aa15.06■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 TNNQ9UQP3 1299 aa15.06■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.06■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 APBB1O00213 710 aa15.06■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.05■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 MBD5Q9P267 1494 aa15.05■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
PRRX1-207ENST00000497230 PZPP20742 1482 aa15.05■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.05■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 PPP2R1AP30153 589 aa15.04■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.04■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.04■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.03■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 LNPKQ9C0E8 428 aa15.02■□□□□ -0
PRRX1-207ENST00000497230 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.02□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 RNF214Q8ND24 703 aa15.01□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PTPRGP23470 1445 aa15.01□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 E9PSI1 815 aa15.01□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 SLFN5Q08AF3 891 aa15□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.99□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLXNC1O60486 1568 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 UNC13BO14795 1591 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ABCC2Q92887 1545 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 JPH4Q96JJ6 628 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.98□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MCTP1Q6DN14 999 aa14.97□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 MORC1Q86VD1 984 aa14.97□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.97□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRX1-207ENST00000497230 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.96□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 TPM2P07951 284 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 ERBB4Q15303 1308 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 UQCRHP07919 91 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRX1-207ENST00000497230 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms