RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495280.5

PRRX1-205, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-205ENST00000495280 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 BCAMP50895 628 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 EYA1Q99502 592 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 SOWAHBA6NEL2 793 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 CCDC102AQ96A19 550 aa8.99□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.98□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 AK7Q96M32 723 aa8.98□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.97□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 PHOX2BQ99453 314 aa8.97□□□□□ -0.97
PRRX1-205ENST00000495280 WBP1LQ9NX94 342 aa8.96□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 RCCD1A6NED2 376 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 NLRP7Q8WX94 980 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM66O15016 1216 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 DNAJB2P25686 324 aa8.93□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.91□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-205ENST00000495280 PDE4DQ08499 809 aa8.88□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 LRCH3Q96II8 777 aa8.88□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 AMHR2Q16671 573 aa8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 RNF40O75150 1001 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 CLCN1P35523 988 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 SLC4A3P48751 1232 aa8.85□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.85□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 PPP4CP60510 307 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 SLF2Q8IX21 1173 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-205ENST00000495280 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.83□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 SLC10A3P09131 477 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 RDH13Q8NBN7 331 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 NEUROD2Q15784 382 aa8.8□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.8□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.8□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 SULF1Q8IWU6 871 aa8.8□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-205ENST00000495280 MS4A1P11836 297 aa8.77□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 TREML4Q6UXN2 200 aa8.77□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.76□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 CD46P15529 392 aa8.76□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 NECTIN2Q92692 538 aa8.76□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.76□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 CFHP08603 1231 aa8.75□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 GCGRP47871 477 aa8.75□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 POTECB2RU33 542 aa8.74□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 APLP1P51693 650 aa8.74□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.74□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.73□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 FAM117AQ9C073 453 aa8.72□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 IL21Q9HBE4 155 aa8.72□□□□□ -1.01
PRRX1-205ENST00000495280 MYT1Q01538 1121 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 IL27Q8NEV9 243 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 KDM4AO75164 1064 aa8.7□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 MTRQ99707 1265 aa8.7□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 PRR14Q9BWN1 585 aa8.7□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 FUT2Q10981 343 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.68□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 STK17AQ9UEE5 414 aa8.68□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 DGAT1O75907 488 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 ATP6V1AP38606 617 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 COPS2P61201 443 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 PKDCCQ504Y2 493 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-205ENST00000495280 NDUFV2P19404 249 aa8.64□□□□□ -1.03
PRRX1-205ENST00000495280 USP46P62068 366 aa8.64□□□□□ -1.03
PRRX1-205ENST00000495280 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.64□□□□□ -1.03
PRRX1-205ENST00000495280 ZNF516Q92618 1163 aa8.64□□□□□ -1.03
PRRX1-205ENST00000495280 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 733.6 ms