RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.59■■■■□ 3.61
HOXB3-210ENST00000489475 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.58■■■■□ 3.61
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HOXB3-210ENST00000489475 TNRQ92752 1358 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXB3-210ENST00000489475 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXB3-210ENST00000489475 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
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HOXB3-210ENST00000489475 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXB3-210ENST00000489475 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.51■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.5■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3C2GO75747 1445 aa37.49■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYVE9O95405 1425 aa37.47■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 C3P01024 1663 aa37.46■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC7Q96M83 1385 aa37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-210ENST00000489475 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
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HOXB3-210ENST00000489475 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
HOXB3-210ENST00000489475 IQGAP1P46940 1657 aa37.39■■■■□ 3.58
HOXB3-210ENST00000489475 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.38■■■■□ 3.58
HOXB3-210ENST00000489475 MIER1Q8N108 512 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP1Q9C000 1473 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXB3-210ENST00000489475 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXB3-210ENST00000489475 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.34■■■■□ 3.57
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HOXB3-210ENST00000489475 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-210ENST00000489475 TESK2Q96S53 571 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-210ENST00000489475 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRB1O14514 1584 aa37.25■■■■□ 3.55
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HOXB3-210ENST00000489475 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.22■■■■□ 3.55
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.2■■■■□ 3.55
HOXB3-210ENST00000489475 TMF1P82094 1093 aa37.2■■■■□ 3.54
HOXB3-210ENST00000489475 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
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HOXB3-210ENST00000489475 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXB3-210ENST00000489475 ALKQ9UM73 1620 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXB3-210ENST00000489475 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXB3-210ENST00000489475 SLC24A1O60721 1099 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXB3-210ENST00000489475 ANP32CO43423 234 aa37.11■■■■□ 3.53
HOXB3-210ENST00000489475 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
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HOXB3-210ENST00000489475 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
HOXB3-210ENST00000489475 CDCA8Q53HL2 280 aa37.06■■■■□ 3.52
HOXB3-210ENST00000489475 EID1Q9Y6B2 187 aa37.05■■■■□ 3.52
HOXB3-210ENST00000489475 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.04■■■■□ 3.52
HOXB3-210ENST00000489475 SLIT1O75093 1534 aa37.04■■■■□ 3.52
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HOXB3-210ENST00000489475 PTPRMP28827 1452 aa37■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 LTKP29376 864 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.98■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
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HOXB3-210ENST00000489475 METP08581 1390 aa36.89■■■■□ 3.5
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HOXB3-210ENST00000489475 ABCC11Q96J66 1382 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXB3-210ENST00000489475 PRAM1Q96QH2 718 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXB3-210ENST00000489475 DLC1Q96QB1 1528 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXB3-210ENST00000489475 CCER2I3L3R5 266 aa36.83■■■■□ 3.49
HOXB3-210ENST00000489475 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
HOXB3-210ENST00000489475 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
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HOXB3-210ENST00000489475 PANK3Q9H999 370 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXB3-210ENST00000489475 MED14O60244 1454 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXB3-210ENST00000489475 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXB3-210ENST00000489475 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXB3-210ENST00000489475 TBX22Q9Y458 520 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 TECPR2O15040 1411 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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HOXB3-210ENST00000489475 DIP2AQ14689 1571 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 MYOM1P52179 1685 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 SIRT1Q96EB6 747 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
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HOXB3-210ENST00000489475 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXB3-210ENST00000489475 CPS1P31327 1500 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.66■■■■□ 3.46
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