RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-7P63135 1459 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 POTEAQ6S8J7 498 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 NOS1P29475 1434 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 TRPM2O94759 1503 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 UBR1Q8IWV7 1749 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 LTKP29376 864 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 FOXD1Q16676 465 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-211ENST00000488243 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
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NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 EID1Q9Y6B2 187 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 SLIT1O75093 1534 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 STAC3Q96MF2 364 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-211ENST00000488243 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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NISCH-211ENST00000488243 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 TMEM94Q12767 1356 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.89■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 CLTCL1P53675 1640 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 NEUROD1Q13562 356 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 TONSLQ96HA7 1378 aa16.88■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.87■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.86■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 KIF1BO60333 1816 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 KCNA6P17658 529 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 ADGRB3O60242 1522 aa16.84■□□□□ 0.29
NISCH-211ENST00000488243 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 BCANQ96GW7 911 aa16.82■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.81■□□□□ 0.28
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NISCH-211ENST00000488243 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.79■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 ZFYVE9O95405 1425 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 MSH6P52701 1360 aa16.77■□□□□ 0.28
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NISCH-211ENST00000488243 RGL3Q3MIN7 710 aa16.77■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NISCH-211ENST00000488243 JCADQ9P266 1359 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-211ENST00000488243 PHLPP1O60346 1717 aa16.76■□□□□ 0.27
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NISCH-211ENST00000488243 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NISCH-211ENST00000488243 NWD1Q149M9 1564 aa16.76■□□□□ 0.27
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NISCH-211ENST00000488243 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-211ENST00000488243 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-211ENST00000488243 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-211ENST00000488243 IFT172Q9UG01 1749 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 PPLO60437 1756 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 C14orf37Q86TY3 774 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 LRP6O75581 1613 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 RXRBP28702 533 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 PIK3C2GO75747 1445 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
NISCH-211ENST00000488243 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.64■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 LAMC1P11047 1609 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 TBX22Q9Y458 520 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 ATF3P18847 181 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 DIP2AQ14689 1571 aa16.59■□□□□ 0.25
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