RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	CUL7	Q14999	1698 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	BCAR3	O75815	825 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCNJ4	P48050	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D23-208	ENST00000486274	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26	1e-6	■■■■■ 32.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	MS4A1	P11836	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	BECN1	Q14457	450 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274		E9PSI1	815 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	TEF	Q10587	303 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	FANCA	O15360	1455 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	EVA1C	P58658	441 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATF3	P18847	181 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	NME9	Q86XW9	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	FOXO3	O43524	673 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBC1D23-208	ENST00000486274	FGD1	P98174	961 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOS1	P29475	1434 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF14	Q15058	1648 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	PDE4A	P27815	886 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TBC1D23-208	ENST00000486274	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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