RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484988.2

SGIP1-211, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-211ENST00000484988 MAP2K5Q13163 448 aa7.28□□□□□ -1.24
SGIP1-211ENST00000484988 NECTIN2Q92692 538 aa7.28□□□□□ -1.24
SGIP1-211ENST00000484988 PHOX2BQ99453 314 aa7.28□□□□□ -1.24
SGIP1-211ENST00000484988 IRF6O14896 467 aa7.27□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 RNF40O75150 1001 aa7.27□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 APLP1P51693 650 aa7.27□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 SLC4A3P48751 1232 aa7.26□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 SLC10A3P09131 477 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGIP1-211ENST00000484988 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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SGIP1-211ENST00000484988 ZMYND10O75800 440 aa7.24□□□□□ -1.25
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SGIP1-211ENST00000484988 KCNC4Q03721 635 aa7.23□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 CCDC102AQ96A19 550 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 MTRQ99707 1265 aa7.22□□□□□ -1.25
SGIP1-211ENST00000484988 A0A0G2JS52 829 aa7.21□□□□□ -1.26
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SGIP1-211ENST00000484988 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGIP1-211ENST00000484988 ZNF516Q92618 1163 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGIP1-211ENST00000484988 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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SGIP1-211ENST00000484988 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SGIP1-211ENST00000484988 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.16□□□□□ -1.26
SGIP1-211ENST00000484988 RDH13Q8NBN7 331 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGIP1-211ENST00000484988 GCGRP47871 477 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-211ENST00000484988 CD46P15529 392 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-211ENST00000484988 CLCN1P35523 988 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-211ENST00000484988 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGIP1-211ENST00000484988 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SGIP1-211ENST00000484988 NR1I2O75469 434 aa7.11□□□□□ -1.27
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SGIP1-211ENST00000484988 FUT2Q10981 343 aa7.11□□□□□ -1.27
SGIP1-211ENST00000484988 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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SGIP1-211ENST00000484988 GGCXP38435 758 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-211ENST00000484988 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-211ENST00000484988 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.06□□□□□ -1.28
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SGIP1-211ENST00000484988 PDE4DQ08499 809 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-211ENST00000484988 SPSB2Q99619 263 aa7.04□□□□□ -1.28
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SGIP1-211ENST00000484988 HOXA2O43364 376 aa7.03□□□□□ -1.28
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SGIP1-211ENST00000484988 S1PR4O95977 384 aa7.03□□□□□ -1.28
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SGIP1-211ENST00000484988 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 Q3C1V9 767 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 BEGAINQ9BUH8 593 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 GUCA2AQ02747 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 MSS51Q4VC12 460 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 FDX1P10109 184 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.97□□□□□ -1.29
SGIP1-211ENST00000484988 NDUFV2P19404 249 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 SLC19A1P41440 591 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.96□□□□□ -1.3
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