RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
USP13-202ENST00000482333 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.09■■■□□ 2.41
USP13-202ENST00000482333 PPLO60437 1756 aa30.07■■■□□ 2.4
USP13-202ENST00000482333 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.05■■■□□ 2.4
USP13-202ENST00000482333 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
USP13-202ENST00000482333 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.03■■■□□ 2.4
USP13-202ENST00000482333 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.03■■■□□ 2.4
USP13-202ENST00000482333 IDI1Q13907 227 aa29.99■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.98■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.98■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 PIK3C2GO75747 1445 aa29.96■■■□□ 2.39
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USP13-202ENST00000482333 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.95■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.95■■■□□ 2.39
USP13-202ENST00000482333 TMF1P82094 1093 aa29.95■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 ERVK-7P63135 1459 aa29.94■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.93■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 MLECQ14165 292 aa29.92■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.91■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.9■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.9■■■□□ 2.38
USP13-202ENST00000482333 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 ADGRB1O14514 1584 aa29.85■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 MRS2Q9HD23 443 aa29.83■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.83■■■□□ 2.37
USP13-202ENST00000482333 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.8■■■□□ 2.36
USP13-202ENST00000482333 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
USP13-202ENST00000482333 ZFYVE9O95405 1425 aa29.8■■■□□ 2.36
USP13-202ENST00000482333 PANK3Q9H999 370 aa29.77■■■□□ 2.36
USP13-202ENST00000482333 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.76■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 CDCA8Q53HL2 280 aa29.75■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 ZMYM3Q14202 1370 aa29.73■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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USP13-202ENST00000482333 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.72■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 MYOM1P52179 1685 aa29.71■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.71■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 RALBP1Q15311 655 aa29.71■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.71■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
USP13-202ENST00000482333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.34
USP13-202ENST00000482333 SLC24A1O60721 1099 aa29.68■■■□□ 2.34
USP13-202ENST00000482333 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.68■■■□□ 2.34
USP13-202ENST00000482333 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.68■■■□□ 2.34
USP13-202ENST00000482333 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.68■■■□□ 2.34
USP13-202ENST00000482333 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.67■■■□□ 2.34
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USP13-202ENST00000482333 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.66■■■□□ 2.34
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USP13-202ENST00000482333 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
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USP13-202ENST00000482333 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.58■■■□□ 2.33
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USP13-202ENST00000482333 TNRQ92752 1358 aa29.57■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 ALKQ9UM73 1620 aa29.57■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.54■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 NLRP13Q86W25 1043 aa29.53■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 STK26Q9P289 416 aa29.52■■■□□ 2.32
USP13-202ENST00000482333 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 PTPRMP28827 1452 aa29.49■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.48■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.46■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.46■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.45■■■□□ 2.31
USP13-202ENST00000482333 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
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USP13-202ENST00000482333 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.44■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.44■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.44■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 C3P01024 1663 aa29.43■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 EVC2Q86UK5 1308 aa29.43■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 PRAM1Q96QH2 718 aa29.4■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.39■■■□□ 2.3
USP13-202ENST00000482333 NLRP1Q9C000 1473 aa29.38■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.37■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 PPP2R1AP30153 589 aa29.36■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 POGKQ9P215 609 aa29.35■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 CABP2Q9NPB3 220 aa29.34■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 DLC1Q96QB1 1528 aa29.34■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
USP13-202ENST00000482333 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 METP08581 1390 aa29.31■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.31■■■□□ 2.28
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