RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 PLA2R1Q13018 1463 aa9.5□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.49□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 ERVK-7P63135 1459 aa9.49□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 PKD2Q13563 968 aa9.49□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 ERBINQ96RT1 1412 aa9.48□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.48□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 PIK3C2BO00750 1634 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 IQGAP1P46940 1657 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 HAX1O00165 279 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 ITGAEP38570 1179 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 NLRP1Q9C000 1473 aa9.47□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
MITF-215ENST00000478490 FKBP8Q14318 412 aa9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 KANK1Q14678 1352 aa9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 ADGRL2O95490 1459 aa9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.45□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 PROM2Q8N271 834 aa9.44□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 SYNMO15061 1565 aa9.44□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.44□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.43□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.43□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.42□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 TET3O43151 1660 aa9.42□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 EVX2Q03828 476 aa9.42□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 UNC13BO14795 1591 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 E9PCH4 1651 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.41□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 MED14O60244 1454 aa9.4□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 LTKP29376 864 aa9.4□□□□□ -0.9
MITF-215ENST00000478490 IDI1Q13907 227 aa9.39□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.39□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 CREBZFQ9NS37 354 aa9.39□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 PIP4K2BP78356 416 aa9.38□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 SLIT1O75093 1534 aa9.38□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 CPS1P31327 1500 aa9.38□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.38□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 ADGRB3O60242 1522 aa9.37□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.37□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 NOS1P29475 1434 aa9.37□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 EID1Q9Y6B2 187 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 ALKQ9UM73 1620 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 ROCK1Q13464 1354 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.35□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 BCANQ96GW7 911 aa9.34□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.34□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.34□□□□□ -0.91
MITF-215ENST00000478490 NUP155O75694 1391 aa9.33□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 HSPA1LP34931 641 aa9.32□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 TOM1O60784 492 aa9.31□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.31□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 KIF1BO60333 1816 aa9.31□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.31□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 ILDR2Q71H61 639 aa9.3□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 ZFYVE9O95405 1425 aa9.29□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 CLTCL1P53675 1640 aa9.29□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 NAIPQ13075 1403 aa9.28□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 TRIM52Q96A61 297 aa9.27□□□□□ -0.92
MITF-215ENST00000478490 TMEM94Q12767 1356 aa9.27□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 NWD1Q149M9 1564 aa9.27□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 KCNA6P17658 529 aa9.26□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.26□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.25□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.25□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 MIER1Q8N108 512 aa9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 PHLPP1O60346 1717 aa9.23□□□□□ -0.93
MITF-215ENST00000478490 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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