RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.33	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.32	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		33.32	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.32	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.32	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.29	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.27	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.26	■■■□□ 2.92
MTA1-209	ENST00000469140	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.26	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	LAMC1	P11047	1609 aa		33.25	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	USP47	Q96K76	1375 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.2	■■■□□ 2.91
MTA1-209	ENST00000469140	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.2	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	PTPRM	P28827	1452 aa		33.2	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.17	■■■□□ 2.9
MTA1-209	ENST00000469140	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
MTA1-209	ENST00000469140	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.12	■■■□□ 2.89
MTA1-209	ENST00000469140	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
MTA1-209	ENST00000469140	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
MTA1-209	ENST00000469140	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MTA1-209	ENST00000469140	SLIT1	O75093	1534 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.04	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
MTA1-209	ENST00000469140	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.97	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	LTK	P29376	864 aa		32.97	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.97	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MTA1-209	ENST00000469140	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	TESK2	Q96S53	571 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MTA1-209	ENST00000469140	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	TMF1	P82094	1093 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MTA1-209	ENST00000469140	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	MED14	O60244	1454 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	MET	P08581	1390 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	STK26	Q9P289	416 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.78	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
MTA1-209	ENST00000469140	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MTA1-209	ENST00000469140	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	TECPR2	O15040	1411 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	POGK	Q9P215	609 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MTA1-209	ENST00000469140	CPS1	P31327	1500 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.59	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MTA1-209	ENST00000469140	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8

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