RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.63■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.62■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 PIK3C2BO00750 1634 aa25.6■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 PPLO60437 1756 aa25.59■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.59■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.58■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
NME4-210ENST00000468031 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 REREQ9P2R6 1566 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 CDCA8Q53HL2 280 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 SLC24A1O60721 1099 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 SYNMO15061 1565 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 PIK3C2GO75747 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 TSPOAP1O95153 1857 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-210ENST00000468031 NEFLP07196 543 aa25.51■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 TMC1Q8TDI8 760 aa25.51■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 PANK3Q9H999 370 aa25.49■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 AGLP35573 1532 aa25.49■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.47■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 NLRP13Q86W25 1043 aa25.47■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 FKBP8Q14318 412 aa25.46■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.46■■□□□ 1.67
NME4-210ENST00000468031 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.45■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.44■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 MYOM1P52179 1685 aa25.44■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 ADGRB1O14514 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.44■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.43■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 ERVK-7P63135 1459 aa25.42■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 ZFYVE9O95405 1425 aa25.4■■□□□ 1.66
NME4-210ENST00000468031 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 IDI1Q13907 227 aa25.36■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 INSRP06213 1382 aa25.36■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.36■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.35■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.35■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.34■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.34■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
NME4-210ENST00000468031 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.31■■□□□ 1.64
NME4-210ENST00000468031 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NME4-210ENST00000468031 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-210ENST00000468031 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-210ENST00000468031 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NME4-210ENST00000468031 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 BCANQ96GW7 911 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 NUDCQ9Y266 331 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-210ENST00000468031 PPP2R1AP30153 589 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-210ENST00000468031 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NME4-210ENST00000468031 PDE3BQ13370 1112 aa25.14■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 USP32Q8NFA0 1604 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 EVC2Q86UK5 1308 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 ALKQ9UM73 1620 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 PTPRMP28827 1452 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NME4-210ENST00000468031 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 MLECQ14165 292 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 ZMYM3Q14202 1370 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 DLC1Q96QB1 1528 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-210ENST00000468031 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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