RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 KIF1BO60333 1816 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 STAC3Q96MF2 364 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 C3P01024 1663 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 MYOM2P54296 1465 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 USP47Q96K76 1375 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 PIK3C2GO75747 1445 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPN3-209ENST00000466222 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP1Q9C000 1473 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRMP28827 1452 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 IFT172Q9UG01 1749 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 PPLO60437 1756 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 ZFYVE9O95405 1425 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 LTKP29376 864 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPN3-209ENST00000466222 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPN3-209ENST00000466222 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 BCANQ96GW7 911 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 TESK2Q96S53 571 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 STK26Q9P289 416 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRB1O14514 1584 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 EID1Q9Y6B2 187 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 LAMC1P11047 1609 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC7Q96M83 1385 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 ALKQ9UM73 1620 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 SLIT1O75093 1534 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 METP08581 1390 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.83■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 IQGAP1P46940 1657 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA2P54652 639 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 PRAM1Q96QH2 718 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 TMF1P82094 1093 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 MED14O60244 1454 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
CAPN3-209ENST00000466222 POGKQ9P215 609 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 TBX22Q9Y458 520 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC11Q96J66 1382 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRUQ92729 1446 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPN3-209ENST00000466222 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 CABP2Q9NPB3 220 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 KCNA6P17658 529 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPN3-209ENST00000466222 CDCA8Q53HL2 280 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPN3-209ENST00000466222 TECPR2O15040 1411 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPN3-209ENST00000466222 SLC24A1O60721 1099 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPN3-209ENST00000466222 DLC1Q96QB1 1528 aa25.56■■□□□ 1.68
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