RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AK7Q96M32 723 aa8.9□□□□□ -0.99
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTPRTO14522 1441 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLA2R1Q13018 1463 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IRF5Q13568 498 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AFAP1Q8N556 730 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RETREG2Q8NC44 543 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FECHP22830 423 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ADGRL2O95490 1459 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ERBINQ96RT1 1412 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.01
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