RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.71■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 IDI1Q13907 227 aa30.71■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.71■■■□□ 2.513e-6■■□□□ 11.4
GTPBP1-202ENST00000418601 KANK1Q14678 1352 aa30.68■■■□□ 2.5
GTPBP1-202ENST00000418601 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.67■■■□□ 2.5
GTPBP1-202ENST00000418601 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.66■■■□□ 2.5
GTPBP1-202ENST00000418601 DIP2AQ14689 1571 aa30.65■■■□□ 2.5
GTPBP1-202ENST00000418601 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 RGS12O14924 1447 aa30.62■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 C14orf37Q86TY3 774 aa30.61■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 NOS1P29475 1434 aa30.61■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.59■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 ZFYVE9O95405 1425 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 AFF2P51816 1311 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-202ENST00000418601 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.57■■■□□ 2.48
GTPBP1-202ENST00000418601 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.55■■■□□ 2.48
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC5O15440 1437 aa30.52■■■□□ 2.48
GTPBP1-202ENST00000418601 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.52■■■□□ 2.48
GTPBP1-202ENST00000418601 ATF3P18847 181 aa30.51■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.49■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 BRINP3Q76B58 766 aa30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.46■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-202ENST00000418601 DAPK1P53355 1430 aa30.45■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 TBX22Q9Y458 520 aa30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.43■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 C8orf37Q96NL8 207 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.39■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
GTPBP1-202ENST00000418601 DCCP43146 1447 aa30.39■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.38■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 TRPM2O94759 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 PIK3R4Q99570 1358 aa30.37■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.37■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.34■■■□□ 2.45
GTPBP1-202ENST00000418601 MST1RQ04912 1400 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 FOXD1Q16676 465 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.31■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPRUQ92729 1446 aa30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 NGLY1Q96IV0 654 aa30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 UNC13BO14795 1591 aa30.27■■■□□ 2.44
GTPBP1-202ENST00000418601 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.26■■■□□ 2.43
GTPBP1-202ENST00000418601 ADAMTS2O95450 1211 aa30.22■■■□□ 2.43
GTPBP1-202ENST00000418601 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRL2O95490 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.17■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.17■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 E9PCH4 1651 aa30.17■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 USP21Q9UK80 565 aa30.15■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.14■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 EP400Q96L91 3159 aa30.14■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.13■■■□□ 2.41
GTPBP1-202ENST00000418601 ATRNO75882 1429 aa30.12■■■□□ 2.41
GTPBP1-202ENST00000418601 LAMC1P11047 1609 aa30.11■■■□□ 2.41
GTPBP1-202ENST00000418601 PTCH1Q13635 1447 aa30.08■■■□□ 2.41
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC125Q86Z20 511 aa30.06■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.05■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.04■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 LRP5O75197 1615 aa30.04■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
GTPBP1-202ENST00000418601 METP08581 1390 aa30.01■■■□□ 2.39
GTPBP1-202ENST00000418601 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
GTPBP1-202ENST00000418601 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GTPBP1-202ENST00000418601 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 MYOM2P54296 1465 aa29.94■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.93■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 APLP2Q06481 763 aa29.9■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 ORAI2Q96SN7 254 aa29.9■■■□□ 2.38
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.87■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.86■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 GLI3P10071 1580 aa29.86■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
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