RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 SYNMO15061 1565 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-205ENST00000414009 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-205ENST00000414009 IDI1Q13907 227 aa21.74■■□□□ 1.07
HPS1-205ENST00000414009 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HPS1-205ENST00000414009 PIK3C2BO00750 1634 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS1-205ENST00000414009 PTPRTO14522 1441 aa21.7■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 PLA2R1Q13018 1463 aa21.7■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.69■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.68■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 ADGRB3O60242 1522 aa21.67■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 TRPM2O94759 1503 aa21.67■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 EID1Q9Y6B2 187 aa21.66■■□□□ 1.06
HPS1-205ENST00000414009 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.64■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 STRCQ7RTU9 1775 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 KIF1BO60333 1816 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 CLTCL1P53675 1640 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 SLIT1O75093 1534 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.58■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HPS1-205ENST00000414009 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.58■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 BCANQ96GW7 911 aa21.54■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 LTKP29376 864 aa21.53■■□□□ 1.04
HPS1-205ENST00000414009 MED14O60244 1454 aa21.52■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.51■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 IQGAP1P46940 1657 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 ZFYVE9O95405 1425 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 RGL3Q3MIN7 710 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-205ENST00000414009 PPLO60437 1756 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS1-205ENST00000414009 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HPS1-205ENST00000414009 TBX22Q9Y458 520 aa21.35■■□□□ 1.01
HPS1-205ENST00000414009 DIP2AQ14689 1571 aa21.34■■□□□ 1.01
HPS1-205ENST00000414009 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.32■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 NEUROD1Q13562 356 aa21.32■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 IFT172Q9UG01 1749 aa21.32■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 POTEHQ6S545 545 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 STAC3Q96MF2 364 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.3■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 CPS1P31327 1500 aa21.3■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 PIK3R4Q99570 1358 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 KCNA6P17658 529 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 CERKQ8TCT0 537 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 MYOM2P54296 1465 aa21.27■■□□□ 1
HPS1-205ENST00000414009 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.26■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 ALKQ9UM73 1620 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 PIK3C2GO75747 1445 aa21.22■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.22■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.21■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 NWD1Q149M9 1564 aa21.21■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.21■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 TONSLQ96HA7 1378 aa21.21■□□□□ 0.99
HPS1-205ENST00000414009 METP08581 1390 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 LAMC1P11047 1609 aa21.19■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.17■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.16■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 PTPRUQ92729 1446 aa21.15■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 C14orf37Q86TY3 774 aa21.15■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 TMEM94Q12767 1356 aa21.14■□□□□ 0.98
HPS1-205ENST00000414009 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.13■□□□□ 0.97
HPS1-205ENST00000414009 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HPS1-205ENST00000414009 STK26Q9P289 416 aa21.12■□□□□ 0.97
HPS1-205ENST00000414009 AKT1S1Q96B36 256 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms