RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SUMO3-204ENST00000411651 NOS1P29475 1434 aa27.52■■■□□ 2
SUMO3-204ENST00000411651 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.5■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 RAPGEF3O95398 923 aa27.5■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 CDCA8Q53HL2 280 aa27.49■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.49■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3C2BO00750 1634 aa27.48■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.48■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.48■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 NEFLP07196 543 aa27.47■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 REREQ9P2R6 1566 aa27.46■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 GGT6Q6P531 493 aa27.45■■□□□ 1.99
SUMO3-204ENST00000411651 SYNMO15061 1565 aa27.45■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 PPLO60437 1756 aa27.45■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.44■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.41■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.41■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3C2GO75747 1445 aa27.4■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.4■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 TMC1Q8TDI8 760 aa27.39■■□□□ 1.98
SUMO3-204ENST00000411651 NLRP13Q86W25 1043 aa27.39■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.39■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 INSRP06213 1382 aa27.39■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.37■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 FKBP8Q14318 412 aa27.37■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 AGLP35573 1532 aa27.37■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 PANK3Q9H999 370 aa27.34■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.33■■□□□ 1.97
SUMO3-204ENST00000411651 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.32■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.31■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.31■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 MYOM1P52179 1685 aa27.31■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.31■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 ZFYVE9O95405 1425 aa27.3■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRB1O14514 1584 aa27.3■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.28■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.28■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 ERVK-7P63135 1459 aa27.27■■□□□ 1.96
SUMO3-204ENST00000411651 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.23■■□□□ 1.95
SUMO3-204ENST00000411651 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SUMO3-204ENST00000411651 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SUMO3-204ENST00000411651 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.21■■□□□ 1.95
SUMO3-204ENST00000411651 TSPOAP1O95153 1857 aa27.21■■□□□ 1.95
SUMO3-204ENST00000411651 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.18■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.18■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.17■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 NUDCQ9Y266 331 aa27.16■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.15■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 IDI1Q13907 227 aa27.15■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.1■■□□□ 1.93
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SUMO3-204ENST00000411651 PDE3BQ13370 1112 aa27.08■■□□□ 1.93
SUMO3-204ENST00000411651 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.07■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 BCANQ96GW7 911 aa27.06■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.06■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 PPP2R1AP30153 589 aa27.05■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 USP32Q8NFA0 1604 aa27.04■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.03■■□□□ 1.92
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.98■■□□□ 1.91
SUMO3-204ENST00000411651 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.98■■□□□ 1.91
SUMO3-204ENST00000411651 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.96■■□□□ 1.91
SUMO3-204ENST00000411651 EVC2Q86UK5 1308 aa26.96■■□□□ 1.91
SUMO3-204ENST00000411651 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
SUMO3-204ENST00000411651 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.94■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.93■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRMP28827 1452 aa26.91■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 ALKQ9UM73 1620 aa26.91■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
SUMO3-204ENST00000411651 NSD2O96028 1365 aa26.89■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 DLC1Q96QB1 1528 aa26.88■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.87■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.86■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.84■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.83■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 NGEFQ8N5V2 710 aa26.83■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.83■■□□□ 1.89
SUMO3-204ENST00000411651 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 ZMYM3Q14202 1370 aa26.82■■□□□ 1.88
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