RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 KANK1Q14678 1352 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CCER2I3L3R5 266 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 GGT6Q6P531 493 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.52□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.51□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM69CQ0P6D2 419 aa5.51□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.51□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 TIE1P35590 1138 aa5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP10AO60312 1499 aa5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 A2MP01023 1474 aa5.5□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF12Q96FN5 646 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 IER5LQ5T953 404 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 NEO1Q92859 1461 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 E9PCH4 1651 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CHGAP10645 457 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM5CP41229 1560 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRTO14522 1441 aa5.48□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 POTEIP0CG38 1075 aa5.47□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC184Q52MB2 194 aa5.47□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.47□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 DEPDC5O75140 1603 aa5.47□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 TET3O43151 1660 aa5.46□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.46□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPM2O94759 1503 aa5.46□□□□□ -1.53
LRRTM4-201ENST00000409088 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC39A7Q92504 469 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 MRS2Q9HD23 443 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 STAC3Q96MF2 364 aa5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 CLTCL1P53675 1640 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 C7P10643 843 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa5.45□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA6Q8N139 1617 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 TESK2Q96S53 571 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 NPATQ14207 1427 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 GLI2P10070 1586 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 TMF1P82094 1093 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 LMTK2Q8IWU2 1503 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM212AQ96EL1 285 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP152O94986 1710 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 DIP2BQ9P265 1576 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPOAP1O95153 1857 aa5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 MLECQ14165 292 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 RICTORQ6R327 1708 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 RASEFQ8IZ41 740 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC3O15438 1527 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 IDI1Q13907 227 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 TMC1Q8TDI8 760 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 PANK3Q9H999 370 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 NOS1P29475 1434 aa5.42□□□□□ -1.54
LRRTM4-201ENST00000409088 MADDQ8WXG6 1647 aa5.41□□□□□ -1.54
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