RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397054.7

P3H1-204, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-204ENST00000397054 PTPRTO14522 1441 aa24.67■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.65■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.65■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 PDE4AP27815 886 aa24.65■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.63■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.62■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.62■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 FANCAO15360 1455 aa24.62■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 CEP152O94986 1710 aa24.6■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 BACH2Q9BYV9 841 aa24.59■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 ATP7AQ04656 1500 aa24.59■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 INSRP06213 1382 aa24.58■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.58■■□□□ 1.53
P3H1-204ENST00000397054 ZNF521Q96K83 1311 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 KANK1Q14678 1352 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 CDCA8Q53HL2 280 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 MYOM1P52179 1685 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 DEPDC5O75140 1603 aa24.56■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 TET3O43151 1660 aa24.55■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 ADGRL1O94910 1474 aa24.55■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 APAF1O14727 1248 aa24.55■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 SYNMO15061 1565 aa24.54■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 GOLGA2Q08379 1002 aa24.54■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.54■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 MS4A1P11836 297 aa24.52■■□□□ 1.52
P3H1-204ENST00000397054 ERVK-7P63135 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.51■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.5■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.49■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 SLFN5Q08AF3 891 aa24.49■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.49■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 ABCA6Q8N139 1617 aa24.48■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 PIK3C2GO75747 1445 aa24.48■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 BCAR3O75815 825 aa24.46■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 STAC3Q96MF2 364 aa24.46■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.46■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
P3H1-204ENST00000397054 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.45■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.45■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 ASXL2Q76L83 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.44■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 GGT6Q6P531 493 aa24.43■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 NOS1P29475 1434 aa24.43■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 MROH2AA6NES4 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.41■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.41■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
P3H1-204ENST00000397054 NEUROD2Q15784 382 aa24.39■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.38■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 MYOM2P54296 1465 aa24.38■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.38■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.36■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 SLC4A3P48751 1232 aa24.36■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 RGS3P49796 1198 aa24.35■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 KIF1BO60333 1816 aa24.35■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 NEFMP07197 916 aa24.34■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
P3H1-204ENST00000397054 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.33■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 NPATQ14207 1427 aa24.32■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 MORC1Q86VD1 984 aa24.31■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 IFT172Q9UG01 1749 aa24.31■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.3■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 E9PSI1 815 aa24.29■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 WWC1Q8IX03 1113 aa24.29■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 C8orf34Q49A92 452 aa24.28■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 PANK1Q8TE04 598 aa24.27■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 IGHDP01880 384 aa24.27■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 ADGRB3O60242 1522 aa24.27■■□□□ 1.48
P3H1-204ENST00000397054 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.26■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.26■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 RAPGEF3O95398 923 aa24.26■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 TNNQ9UQP3 1299 aa24.25■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 COG6Q9Y2V7 657 aa24.24■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.24■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 MTHFSP49914 203 aa24.23■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.23■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
P3H1-204ENST00000397054 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms