RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF40O75150 1001 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GDF11O95390 407 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RASSF7Q02833 373 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SENP2Q9HC62 589 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 S1PR4O95977 384 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLA2G2CQ5R387 149 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCE3BQ5TA77 95 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERBB4Q15303 1308 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C3orf80F5H4A9 247 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TLL1O43897 1013 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPAS3Q8IXF0 933 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CYP4X1Q8N118 509 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NECTIN2Q92692 538 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIFC2Q96AC6 838 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EPAS1Q99814 870 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 H3BM21 787 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VEGFBP49765 207 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HDGFP51858 240 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPAT2Q6NUI2 795 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM198AQ9UFP1 575 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGHA1P01876 353 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TATDN2Q93075 761 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDCA7LQ96GN5 454 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EMILIN3Q9NT22 766 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NBPF26B4DH59 902 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADAM23O75077 832 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMPD1P17405 629 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDE4AP27815 886 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PNMA3Q9UL41 463 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRSS12P56730 875 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLF2Q8IX21 1173 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRR14Q9BWN1 585 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BTBD11A6QL63 1104 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADH1BP00325 375 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPIAP49247 311 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NUDT18Q6ZVK8 323 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC6A16Q9GZN6 736 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOXK2Q01167 660 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q8N3U1 123 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1177P-201ENST00000391058 J3QL48 77 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAP3K7O43318 606 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VSIG8P0DPA2 414 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDX12PQ92771 950 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HPS1Q92902 700 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADAMTS8Q9UP79 889 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RGL2O15211 777 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NBR1Q14596 966 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MFSD10Q14728 455 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CERKQ8TCT0 537 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WNT7AO00755 349 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IRS1P35568 1242 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC4A3P48751 1232 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BMP1P13497 986 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIM46Q7Z4K8 759 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MSTNO14793 375 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NR1I2O75469 434 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KANK3Q6NY19 840 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRGPRX2Q96LB1 330 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPSB2Q99619 263 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DPYSL4O14531 572 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KMT5BQ4FZB7 885 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCUBE3Q8IX30 993 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPOCK3Q9BQ16 436 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1177P-201ENST00000391058 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT76Q01546 638 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HS6ST3Q8IZP7 471 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC13Q8NBP0 860 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EYA1Q99502 592 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PROCP04070 461 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITGB2P05107 769 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CFHP08603 1231 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms