RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZPR1O75312 459 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CFHP08603 1231 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HIC1Q14526 733 aa7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.43□□□□□ -1.22
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 TLL1O43897 1013 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC10A3P09131 477 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FECHP22830 423 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GNPATO15228 680 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GFRA3O60609 400 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LAPTM4AQ15012 233 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RNF223E7ERA6 249 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LCE2BO14633 110 aa7.37□□□□□ -1.23
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 NLRP7Q8WX94 980 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 S1PR4O95977 384 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NR1I2O75469 434 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ADH1BP00325 375 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RDH13Q8NBN7 331 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC19A1P41440 591 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.3□□□□□ -1.24
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 MORN1Q5T089 497 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPRYD7Q5W111 196 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SULF1Q8IWU6 871 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1040P-201ENST00000383974 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.28□□□□□ -1.24
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 GCGRP47871 477 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MAP2K5Q13163 448 aa7.26□□□□□ -1.25
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 THAP11Q96EK4 314 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.25□□□□□ -1.25
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRR20CP86479 221 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRR20DP86480 221 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRR20BP86481 221 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRR20AP86496 221 aa7.23□□□□□ -1.25
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 BRICD5Q6PL45 260 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCDC102AQ96A19 550 aa7.2□□□□□ -1.26
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RNU6-1040P-201ENST00000383974 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MSS51Q4VC12 460 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM187AA6NFU0 413 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KDM4AO75164 1064 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DGAT1O75907 488 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYT1Q01538 1121 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FOXC1Q12948 553 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPIAP49247 311 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 Q3C1V9 767 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF787Q6DD87 383 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HLA-CQ95604 372 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HOXA2O43364 376 aa7.14□□□□□ -1.27
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