RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SETQ01105 290 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 GOLIM4O00461 696 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 KIF20AO95235 890 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 CBX1P83916 185 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 DEF6Q9H4E7 631 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 TMF1P82094 1093 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 TDO2P48775 406 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 KIF15Q9NS87 1388 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 CLCN1P35523 988 aa17.02■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 RALBP1Q15311 655 aa17.02■□□□□ 0.32
CTIF-202ENST00000382998 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.02■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.02■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 UQCRHLA0A096LP55 91 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 UQCRHP07919 91 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 CFAP53Q96M91 514 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 KIF3AQ9Y496 699 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 TRERF1Q96PN7 1200 aa17■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 NEUROD2Q15784 382 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 PLCB2Q00722 1185 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 CD109Q6YHK3 1445 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 MRE11P49959 708 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 TIGD1Q96MW7 591 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 IQGAP2Q13576 1575 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-202ENST00000382998 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 NCOA2Q15596 1464 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 PHF14O94880 888 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 MCCP23508 829 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 ERICH4A6NGS2 130 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 PDE4AP27815 886 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 TEX35Q5T0J7 233 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 NUDCQ9Y266 331 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-202ENST00000382998 NEFHP12036 1026 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 ANAPC15P60006 121 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 GPS2Q13227 327 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 TIAM1Q13009 1591 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 MORC1Q86VD1 984 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 KCNA4P22459 653 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 TOMM22Q9NS69 142 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.85■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 ARHGEF11O15085 1522 aa16.84■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 GBP4Q96PP9 640 aa16.84■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
CTIF-202ENST00000382998 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 H0YHG0 523 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 ATF3P18847 181 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.82■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 NPHP1O15259 732 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 CASC1Q6TDU7 716 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-202ENST00000382998 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms