RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.68■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 IQGAP1P46940 1657 aa33.66■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.65■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 TESK2Q96S53 571 aa33.65■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 PPLO60437 1756 aa33.64■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
SERF1B-201ENST00000380750 IDI1Q13907 227 aa33.63■■■□□ 2.97
SERF1B-201ENST00000380750 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
SERF1B-201ENST00000380750 ERVK-7P63135 1459 aa33.61■■■□□ 2.97
SERF1B-201ENST00000380750 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.59■■■□□ 2.97
SERF1B-201ENST00000380750 MLECQ14165 292 aa33.58■■■□□ 2.97
SERF1B-201ENST00000380750 PIK3C2GO75747 1445 aa33.57■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.54■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.53■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 TMF1P82094 1093 aa33.53■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.52■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.51■■■□□ 2.96
SERF1B-201ENST00000380750 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.51■■■□□ 2.95
SERF1B-201ENST00000380750 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
SERF1B-201ENST00000380750 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
SERF1B-201ENST00000380750 ZFYVE9O95405 1425 aa33.47■■■□□ 2.95
SERF1B-201ENST00000380750 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
SERF1B-201ENST00000380750 ZMYM3Q14202 1370 aa33.43■■■□□ 2.94
SERF1B-201ENST00000380750 ADGRB1O14514 1584 aa33.41■■■□□ 2.94
SERF1B-201ENST00000380750 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.41■■■□□ 2.94
SERF1B-201ENST00000380750 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.39■■■□□ 2.94
SERF1B-201ENST00000380750 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
SERF1B-201ENST00000380750 SLC24A1O60721 1099 aa33.37■■■□□ 2.93
SERF1B-201ENST00000380750 CDCA8Q53HL2 280 aa33.37■■■□□ 2.93
SERF1B-201ENST00000380750 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.36■■■□□ 2.93
SERF1B-201ENST00000380750 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.34■■■□□ 2.93
SERF1B-201ENST00000380750 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.32■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa33.31■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.29■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC184Q52MB2 194 aa33.29■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.27■■■□□ 2.92
SERF1B-201ENST00000380750 PANK3Q9H999 370 aa33.25■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 MRS2Q9HD23 443 aa33.25■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 TNRQ92752 1358 aa33.24■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 RALBP1Q15311 655 aa33.21■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.2■■■□□ 2.91
SERF1B-201ENST00000380750 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.18■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.17■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 MYOM1P52179 1685 aa33.15■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 ALKQ9UM73 1620 aa33.14■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.14■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa33.14■■■□□ 2.9
SERF1B-201ENST00000380750 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
SERF1B-201ENST00000380750 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.11■■■□□ 2.89
SERF1B-201ENST00000380750 FAM9BQ8IZU0 186 aa33.08■■■□□ 2.89
SERF1B-201ENST00000380750 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
SERF1B-201ENST00000380750 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
SERF1B-201ENST00000380750 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.07■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 NLRP1Q9C000 1473 aa33.07■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 C3P01024 1663 aa33.05■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.05■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 KNSTRNQ9Y448 316 aa33.05■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 STK26Q9P289 416 aa33.03■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 PTPRMP28827 1452 aa33.03■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 TMC1Q8TDI8 760 aa33.03■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.01■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 NLRP13Q86W25 1043 aa33■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 EVC2Q86UK5 1308 aa32.99■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 TULP4Q9NRJ4 1543 aa32.98■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.97■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.96■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
SERF1B-201ENST00000380750 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 PRAM1Q96QH2 718 aa32.93■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 DLC1Q96QB1 1528 aa32.93■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 POGKQ9P215 609 aa32.91■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.89■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 ABCC11Q96J66 1382 aa32.89■■■□□ 2.86
SERF1B-201ENST00000380750 METP08581 1390 aa32.86■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.86■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.84■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 ZBED9Q6R2W3 1325 aa32.83■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 SLIT1O75093 1534 aa32.83■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.83■■■□□ 2.85
SERF1B-201ENST00000380750 CABP2Q9NPB3 220 aa32.82■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms