RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.68■■■□□ 2.02
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OPN3-201ENST00000366554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
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OPN3-201ENST00000366554 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.64■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
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OPN3-201ENST00000366554 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.64■■■□□ 2.01
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OPN3-201ENST00000366554 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.61■■■□□ 2.01
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OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.45■■□□□ 1.98
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OPN3-201ENST00000366554 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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OPN3-201ENST00000366554 NUP160Q12769 1436 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 RLBP1P12271 317 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.41■■□□□ 1.98
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OPN3-201ENST00000366554 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.4■■□□□ 1.98
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OPN3-201ENST00000366554 TSPY10P0CW01 314 aa27.38■■□□□ 1.97
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OPN3-201ENST00000366554 SMC5Q8IY18 1101 aa27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 GBP4Q96PP9 640 aa27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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OPN3-201ENST00000366554 PTMSP20962 102 aa27.35■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.31■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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OPN3-201ENST00000366554 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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