RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 NOS1P29475 1434 aa24.45■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.42■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.42■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 MROH2AA6NES4 1674 aa24.41■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.41■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 MADDQ8WXG6 1647 aa24.4■■□□□ 1.5
PDE4D-204ENST00000358923 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 PANK3Q9H999 370 aa24.38■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.38■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 TMF1P82094 1093 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PDE4D-204ENST00000358923 STK26Q9P289 416 aa24.33■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.33■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 KIF1BO60333 1816 aa24.32■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 MSH5O43196 834 aa24.32■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 SYNMO15061 1565 aa24.3■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.3■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 FKBP8Q14318 412 aa24.28■■□□□ 1.48
PDE4D-204ENST00000358923 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRB3O60242 1522 aa24.25■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 TMC1Q8TDI8 760 aa24.24■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.23■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PDE4D-204ENST00000358923 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.18■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.18■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 PIK3C2GO75747 1445 aa24.17■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 MYOM2P54296 1465 aa24.17■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 IQGAP1P46940 1657 aa24.16■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 STAC3Q96MF2 364 aa24.16■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.14■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
PDE4D-204ENST00000358923 IFT172Q9UG01 1749 aa24.13■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 LAMC1P11047 1609 aa24.13■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.13■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 PIK3C2BO00750 1634 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 PPLO60437 1756 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 NEFLP07196 543 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.12■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 ZMYM3Q14202 1370 aa24.11■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 ERVK-7P63135 1459 aa24.11■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 CABP2Q9NPB3 220 aa24.1■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.09■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.09■■□□□ 1.45
PDE4D-204ENST00000358923 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 RALBP1Q15311 655 aa24.07■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.05■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRB1O14514 1584 aa24.05■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.04■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.04■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 PRAM1Q96QH2 718 aa24.04■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.03■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.02■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP13Q86W25 1043 aa24.02■■□□□ 1.44
PDE4D-204ENST00000358923 CDCA8Q53HL2 280 aa24.01■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 AGLP35573 1532 aa24.01■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 POGKQ9P215 609 aa23.99■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.98■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.97■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 PPP2R1AP30153 589 aa23.97■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.97■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.96■■□□□ 1.43
PDE4D-204ENST00000358923 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 MYOM1P52179 1685 aa23.93■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 REREQ9P2R6 1566 aa23.93■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.93■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.92■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.91■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.91■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 LTKP29376 864 aa23.9■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 TNRQ92752 1358 aa23.9■■□□□ 1.42
PDE4D-204ENST00000358923 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms