RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 POGKQ9P215 609 aa21.83■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 TESK2Q96S53 571 aa21.82■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.82■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 E9PCH4 1651 aa21.82■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.8■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.8■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 FANCAO15360 1455 aa21.79■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 ATP10AO60312 1499 aa21.79■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 KIF3BO15066 747 aa21.79■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.79■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 RGS3P49796 1198 aa21.78■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.78■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.77■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 PANK3Q9H999 370 aa21.77■■□□□ 1.08
GDE1-201ENST00000353258 TMF1P82094 1093 aa21.75■■□□□ 1.07
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GDE1-201ENST00000353258 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.74■■□□□ 1.07
GDE1-201ENST00000353258 ADGRL1O94910 1474 aa21.72■■□□□ 1.07
GDE1-201ENST00000353258 ATP7AQ04656 1500 aa21.72■■□□□ 1.07
GDE1-201ENST00000353258 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
GDE1-201ENST00000353258 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.72■■□□□ 1.07
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GDE1-201ENST00000353258 LAMC1P11047 1609 aa21.71■■□□□ 1.07
GDE1-201ENST00000353258 ASXL2Q76L83 1435 aa21.7■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.7■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 ZMYND15Q9H091 742 aa21.69■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.69■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 CLTCL1P53675 1640 aa21.69■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.69■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 KANK1Q14678 1352 aa21.68■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 TRPM2O94759 1503 aa21.68■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 ARXQ96QS3 562 aa21.67■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 MADDQ8WXG6 1647 aa21.67■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 USP19O94966 1318 aa21.66■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.65■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.65■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 DEPDC5O75140 1603 aa21.65■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 PTPRTO14522 1441 aa21.64■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 CEP152O94986 1710 aa21.64■■□□□ 1.06
GDE1-201ENST00000353258 INSRP06213 1382 aa21.64■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 TET3O43151 1660 aa21.63■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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GDE1-201ENST00000353258 BECN1Q14457 450 aa21.6■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.6■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
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GDE1-201ENST00000353258 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GDE1-201ENST00000353258 SEC24BO95487 1268 aa21.58■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.57■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.57■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.57■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 PANK2Q9BZ23 570 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 OSCARQ8IYS5 282 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.56■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.55■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 GGT6Q6P531 493 aa21.55■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.55■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 FSD2A1L4K1 749 aa21.52■■□□□ 1.04
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA2Q08379 1002 aa21.51■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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GDE1-201ENST00000353258 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 IGHDP01880 384 aa21.5■■□□□ 1.03
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GDE1-201ENST00000353258 CD109Q6YHK3 1445 aa21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R1AP30153 589 aa21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 CDCA8Q53HL2 280 aa21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 STAC3Q96MF2 364 aa21.5■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.48■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 NLRP1Q9C000 1473 aa21.48■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF521Q96K83 1311 aa21.48■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 KIF1BO60333 1816 aa21.48■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 MROH2AA6NES4 1674 aa21.46■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 ABCA6Q8N139 1617 aa21.46■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.46■■□□□ 1.03
GDE1-201ENST00000353258 RAPGEF3O95398 923 aa21.45■■□□□ 1.02
GDE1-201ENST00000353258 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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