RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 IFT172Q9UG01 1749 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 NOS1P29475 1434 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 IQGAP1P46940 1657 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 REREQ9P2R6 1566 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 TESK2Q96S53 571 aa25.39■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 SYNMO15061 1565 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3C2BO00750 1634 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 AGLP35573 1532 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 MSH5O43196 834 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC184Q52MB2 194 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 PPLO60437 1756 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 TMF1P82094 1093 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 MLECQ14165 292 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 MRS2Q9HD23 443 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3C2GO75747 1445 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 IDI1Q13907 227 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-7P63135 1459 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRB1O14514 1584 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 RALBP1Q15311 655 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 CDCA8Q53HL2 280 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PANK3Q9H999 370 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 ZFYVE9O95405 1425 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 SLC24A1O60721 1099 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRMP28827 1452 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 MYOM1P52179 1685 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TMC1Q8TDI8 760 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYM3Q14202 1370 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP13Q86W25 1043 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 ALKQ9UM73 1620 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 TNRQ92752 1358 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 STK26Q9P289 416 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms