RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.1□□□□□ -0.79
CCR6-202ENST00000349984 DIP2AQ14689 1571 aa10.1□□□□□ -0.79
CCR6-202ENST00000349984 TNRQ92752 1358 aa10.09□□□□□ -0.79
CCR6-202ENST00000349984 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CCR6-202ENST00000349984 ERVK-7P63135 1459 aa10.08□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.08□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 SYNMO15061 1565 aa10.07□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.07□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 E9PCH4 1651 aa10.06□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 IFT172Q9UG01 1749 aa10.06□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 PLA2R1Q13018 1463 aa10.06□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.06□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.05□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.05□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 LAMC1P11047 1609 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 NAIPQ13075 1403 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 FOXD1Q16676 465 aa10.03□□□□□ -0.8
CCR6-202ENST00000349984 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.02□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 NUP155O75694 1391 aa10.02□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 IDI1Q13907 227 aa10.02□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 KANK1Q14678 1352 aa10.01□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 LTKP29376 864 aa10.01□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 NWD1Q149M9 1564 aa10.01□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.01□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.99□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.99□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 NLRP1Q9C000 1473 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 TRIM52Q96A61 297 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 NOS1P29475 1434 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 IQGAP1P46940 1657 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 SLIT1O75093 1534 aa9.98□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 MED14O60244 1454 aa9.97□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 CERKQ8TCT0 537 aa9.97□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.96□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 HFM1A2PYH4 1435 aa9.96□□□□□ -0.81
CCR6-202ENST00000349984 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.96□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.96□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 PTPRTO14522 1441 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 ADGRB3O60242 1522 aa9.95□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 CLTCL1P53675 1640 aa9.94□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 PKD2Q13563 968 aa9.93□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.93□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.93□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 TRPM2O94759 1503 aa9.93□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.92□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 BCANQ96GW7 911 aa9.91□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 ZFYVE9O95405 1425 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 FBXO41Q8TF61 875 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 USP54Q70EL1 1684 aa9.9□□□□□ -0.82
CCR6-202ENST00000349984 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.89□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 ALKQ9UM73 1620 aa9.88□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 NBR1Q14596 966 aa9.88□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.88□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 PIP4K2BP78356 416 aa9.87□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.87□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.87□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.87□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 KIF1BO60333 1816 aa9.86□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.86□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 EID1Q9Y6B2 187 aa9.86□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.86□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 FKBP8Q14318 412 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 RGL3Q3MIN7 710 aa9.85□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 PPLO60437 1756 aa9.84□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.84□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.84□□□□□ -0.83
CCR6-202ENST00000349984 STAC3Q96MF2 364 aa9.83□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 PTPRUQ92729 1446 aa9.83□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 ADGRB2O60241 1585 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms