RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 RALBP1Q15311 655 aa23.58■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 FAM161AQ3B820 660 aa23.56■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 ATP7AQ04656 1500 aa23.54■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.54■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.54■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.53■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.53■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.52■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 RGS3P49796 1198 aa23.52■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 GGT6Q6P531 493 aa23.52■■□□□ 1.36
PKP3-201ENST00000331563 A2MP01023 1474 aa23.51■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.5■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 NLRP13Q86W25 1043 aa23.5■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.49■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 ARXQ96QS3 562 aa23.49■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 POGKQ9P215 609 aa23.48■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.48■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 KDM5CP41229 1560 aa23.48■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 C8orf34Q49A92 452 aa23.48■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.47■■□□□ 1.35
PKP3-201ENST00000331563 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.45■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.45■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.45■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 E9PCH4 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.43■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 KANK1Q14678 1352 aa23.42■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.42■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 ATP10AO60312 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.4■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.4■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PKP3-201ENST00000331563 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.39■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.36■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.34■■□□□ 1.33
PKP3-201ENST00000331563 BECN1Q14457 450 aa23.32■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 CLTCL1P53675 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 DEPDC5O75140 1603 aa23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 TSPOAP1O95153 1857 aa23.31■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 TESK2Q96S53 571 aa23.3■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 PTPRTO14522 1441 aa23.29■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.29■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.28■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.28■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 CLCN1P35523 988 aa23.28■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 TRPM2O94759 1503 aa23.27■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.27■■□□□ 1.32
PKP3-201ENST00000331563 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.27■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 TET3O43151 1660 aa23.27■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 AAMPQ13685 434 aa23.24■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 CEP152O94986 1710 aa23.24■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.24■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.23■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 ABCA6Q8N139 1617 aa23.22■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.22■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.22■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PKP3-201ENST00000331563 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.313e-11■■□□□ 12.9
PKP3-201ENST00000331563 NEO1Q92859 1461 aa23.2■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 NPATQ14207 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.2■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.19■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 FGD1P98174 961 aa23.19■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 PANK3Q9H999 370 aa23.19■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 SEC24BO95487 1268 aa23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 PANK2Q9BZ23 570 aa23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 TMF1P82094 1093 aa23.17■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 USP19O94966 1318 aa23.17■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA2Q08379 1002 aa23.16■■□□□ 1.3
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