RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SYNMO15061 1565 aa15.55■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.55■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.54■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.54■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 AGLP35573 1532 aa15.54■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.53■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 MRS2Q9HD23 443 aa15.53■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.53■□□□□ 0.08
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PGA3-201ENST00000325558 TMF1P82094 1093 aa15.51■□□□□ 0.07
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PGA3-201ENST00000325558 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.51■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 TSPOAP1O95153 1857 aa15.51■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 PIK3C2GO75747 1445 aa15.5■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.5■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.5■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
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PGA3-201ENST00000325558 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PGA3-201ENST00000325558 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.48■□□□□ 0.07
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PGA3-201ENST00000325558 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.46■□□□□ 0.06
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PGA3-201ENST00000325558 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.45■□□□□ 0.06
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PGA3-201ENST00000325558 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.44■□□□□ 0.06
PGA3-201ENST00000325558 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.44■□□□□ 0.06
PGA3-201ENST00000325558 ERVK-7P63135 1459 aa15.44■□□□□ 0.06
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PGA3-201ENST00000325558 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.41■□□□□ 0.06
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PGA3-201ENST00000325558 NLRP13Q86W25 1043 aa15.4■□□□□ 0.06
PGA3-201ENST00000325558 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.39■□□□□ 0.05
PGA3-201ENST00000325558 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
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PGA3-201ENST00000325558 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.29■□□□□ 0.04
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PGA3-201ENST00000325558 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.29■□□□□ 0.04
PGA3-201ENST00000325558 PPP2R1AP30153 589 aa15.29■□□□□ 0.04
PGA3-201ENST00000325558 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.28■□□□□ 0.04
PGA3-201ENST00000325558 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.27■□□□□ 0.04
PGA3-201ENST00000325558 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.27■□□□□ 0.04
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PGA3-201ENST00000325558 ALKQ9UM73 1620 aa15.26■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 PTPRMP28827 1452 aa15.26■□□□□ 0.03
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PGA3-201ENST00000325558 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 USP32Q8NFA0 1604 aa15.25■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 NEFLP07196 543 aa15.24■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 NUDCQ9Y266 331 aa15.24■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 DLC1Q96QB1 1528 aa15.21■□□□□ 0.03
PGA3-201ENST00000325558 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.21■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.2■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.2■□□□□ 0.02
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PGA3-201ENST00000325558 PDE3BQ13370 1112 aa15.19■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 MLECQ14165 292 aa15.17■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.17■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.16■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 ABCC11Q96J66 1382 aa15.16■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.16■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.16■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.15■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 BCANQ96GW7 911 aa15.15■□□□□ 0.02
PGA3-201ENST00000325558 ZNF521Q96K83 1311 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-201ENST00000325558 TNRQ92752 1358 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-201ENST00000325558 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.14■□□□□ 0.01
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