RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320081.9

CLIP4-201, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLIP4, Length 4,293 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-201ENST00000320081 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.61■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 GSE1Q14687 1217 aa20.61■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.6■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 COG3Q96JB2 828 aa20.6■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 GBP4Q96PP9 640 aa20.6■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.59■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLIP4-201ENST00000320081 RUNDC1Q96C34 613 aa20.59■□□□□ 0.89
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CLIP4-201ENST00000320081 GRIN2BQ13224 1484 aa20.57■□□□□ 0.88
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CLIP4-201ENST00000320081 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.56■□□□□ 0.88
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CLIP4-201ENST00000320081 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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CLIP4-201ENST00000320081 DAPK1P53355 1430 aa20.53■□□□□ 0.88
CLIP4-201ENST00000320081 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.53■□□□□ 0.88
CLIP4-201ENST00000320081 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CLIP4-201ENST00000320081 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLIP4-201ENST00000320081 PRAM1Q96QH2 718 aa20.51■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.51■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 EID1Q9Y6B2 187 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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CLIP4-201ENST00000320081 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 PRKAR2BP31323 418 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 HMMRO75330 724 aa20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.49■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 DRC7Q8IY82 874 aa20.49■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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CLIP4-201ENST00000320081 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 BACH2Q9BYV9 841 aa20.48■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.47■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 CABP1Q9NZU7 370 aa20.46■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.46■□□□□ 0.87
CLIP4-201ENST00000320081 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.45■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 MIA2Q96PC5 1412 aa20.45■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.45■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 ARHGEF11O15085 1522 aa20.45■□□□□ 0.86
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CLIP4-201ENST00000320081 USP35Q9P2H5 1018 aa20.43■□□□□ 0.86
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CLIP4-201ENST00000320081 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.39■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 ST18O60284 1047 aa20.39■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 GORABQ5T7V8 394 aa20.39■□□□□ 0.86
CLIP4-201ENST00000320081 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.39■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.37■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.37■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 SYNJ2O15056 1496 aa20.37■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 NLRP6P59044 892 aa20.36■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 ERBINQ96RT1 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 DCTN1Q14203 1278 aa20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 MAPKBP1O60336 1514 aa20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 WWC1Q8IX03 1113 aa20.35■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 HMGXB3Q12766 1538 aa20.34■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.34■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.34■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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CLIP4-201ENST00000320081 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.33■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CLIP4-201ENST00000320081 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 CDK19Q9BWU1 502 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 GNAI1P63096 354 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 MPNDQ8N594 471 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.32■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 KIF16BQ96L93 1317 aa20.31■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 NCOA1Q15788 1441 aa20.31■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 FOSBP53539 338 aa20.31■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLIP4-201ENST00000320081 SLFN5Q08AF3 891 aa20.3■□□□□ 0.84
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