RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 MADDQ8WXG6 1647 aa23.63■■□□□ 1.37
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TSPAN17-201ENST00000298564 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.62■■□□□ 1.37
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TSPAN17-201ENST00000298564 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP152O94986 1710 aa23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC4A3P48751 1232 aa23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 STAC3Q96MF2 364 aa23.58■■□□□ 1.37
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TSPAN17-201ENST00000298564 CDCA8Q53HL2 280 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.49■■□□□ 1.35
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TSPAN17-201ENST00000298564 MYOM1P52179 1685 aa23.33■■□□□ 1.33
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TSPAN17-201ENST00000298564 SLC24A1O60721 1099 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRB3O60242 1522 aa23.29■■□□□ 1.32
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TSPAN17-201ENST00000298564 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.29■■□□□ 1.32
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TSPAN17-201ENST00000298564 RGS3P49796 1198 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 USP35Q9P2H5 1018 aa23.24■■□□□ 1.31
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TSPAN17-201ENST00000298564 GSE1Q14687 1217 aa23.23■■□□□ 1.31
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TSPAN17-201ENST00000298564 NEO1Q92859 1461 aa23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 PPLO60437 1756 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF521Q96K83 1311 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.17■■□□□ 1.3
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