RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 MADDQ8WXG6 1647 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE4AP27815 886 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 TET3O43151 1660 aa23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP152O94986 1710 aa23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC4A3P48751 1232 aa23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 STAC3Q96MF2 364 aa23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17-201ENST00000298564 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 OSCARQ8IYS5 282 aa23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 IQGAP1P46940 1657 aa23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.53■■□□□ 1.36
TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 BACH2Q9BYV9 841 aa23.51■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 CDCA8Q53HL2 280 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 CD109Q6YHK3 1445 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN17-201ENST00000298564 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE3BQ13370 1112 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 CRBNQ96SW2 442 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 GGT6Q6P531 493 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 PPP2R1AP30153 589 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 MYOM2P54296 1465 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF1BO60333 1816 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN17-201ENST00000298564 SYNMO15061 1565 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCA6Q8N139 1617 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 INSRP06213 1382 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 MROH2AA6NES4 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 NOS1P29475 1434 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 NPATQ14207 1427 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPGEF3O95398 923 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 MYOM1P52179 1685 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17-201ENST00000298564 ERVK-7P63135 1459 aa23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 IFT172Q9UG01 1749 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC24A1O60721 1099 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRB3O60242 1522 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 NFKBIBQ15653 356 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 MS4A1P11836 297 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 RGS3P49796 1198 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 PIK3C2GO75747 1445 aa23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 USP35Q9P2H5 1018 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 GSE1Q14687 1217 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCC3O15438 1527 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.22■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 NEO1Q92859 1461 aa23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17-201ENST00000298564 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 PPLO60437 1756 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF521Q96K83 1311 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17-201ENST00000298564 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms