RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.63■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PPLO60437 1756 aa29.62■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 TESK2Q96S53 571 aa29.62■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.6■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.59■■■□□ 2.33
SNRNP25-201ENST00000293861 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.57■■■□□ 2.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.54■■■□□ 2.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.53■■■□□ 2.32
SNRNP25-201ENST00000293861 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.52■■■□□ 2.32
SNRNP25-201ENST00000293861 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 TMF1P82094 1093 aa29.51■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.5■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC184Q52MB2 194 aa29.49■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3C2GO75747 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 ERVK-7P63135 1459 aa29.46■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.46■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 MRS2Q9HD23 443 aa29.46■■■□□ 2.31
SNRNP25-201ENST00000293861 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.45■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 IDI1Q13907 227 aa29.44■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.41■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFYVE9O95405 1425 aa29.39■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC24A1O60721 1099 aa29.39■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.39■■■□□ 2.3
SNRNP25-201ENST00000293861 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 RALBP1Q15311 655 aa29.38■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.38■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 CDCA8Q53HL2 280 aa29.37■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRB1O14514 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MYOM1P52179 1685 aa29.33■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.33■■■□□ 2.29
SNRNP25-201ENST00000293861 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.32■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 MLECQ14165 292 aa29.32■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.3■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 PANK3Q9H999 370 aa29.28■■■□□ 2.28
SNRNP25-201ENST00000293861 ZMYM3Q14202 1370 aa29.24■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.24■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.21■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 TMC1Q8TDI8 760 aa29.2■■■□□ 2.27
SNRNP25-201ENST00000293861 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.2■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.19■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP13Q86W25 1043 aa29.18■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.17■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.16■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
SNRNP25-201ENST00000293861 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.13■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.12■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 TNRQ92752 1358 aa29.1■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.1■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 ALKQ9UM73 1620 aa29.09■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SNRNP25-201ENST00000293861 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SNRNP25-201ENST00000293861 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SNRNP25-201ENST00000293861 INSRP06213 1382 aa29.04■■■□□ 2.24
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
SNRNP25-201ENST00000293861 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRMP28827 1452 aa28.99■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 NEFLP07196 543 aa28.99■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.99■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP1Q9C000 1473 aa28.98■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 EVC2Q86UK5 1308 aa28.98■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.98■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.97■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 FKBP8Q14318 412 aa28.96■■■□□ 2.23
SNRNP25-201ENST00000293861 USP32Q8NFA0 1604 aa28.95■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 C3P01024 1663 aa28.94■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 DLC1Q96QB1 1528 aa28.94■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.94■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 STK26Q9P289 416 aa28.93■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R1AP30153 589 aa28.92■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.92■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.91■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SNRNP25-201ENST00000293861 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SNRNP25-201ENST00000293861 PRAM1Q96QH2 718 aa28.87■■■□□ 2.21
SNRNP25-201ENST00000293861 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.86■■■□□ 2.21
SNRNP25-201ENST00000293861 POGKQ9P215 609 aa28.86■■■□□ 2.21
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