RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF521Q96K83 1311 aa24.4■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.4■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.4■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 GOLGA2Q08379 1002 aa24.39■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.39■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.39■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 RGS3P49796 1198 aa24.37■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.34■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CNIH3-201ENST00000272133 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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CNIH3-201ENST00000272133 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.32■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 ATP10AO60312 1499 aa24.32■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 PLXNC1O60486 1568 aa24.29■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 PLCH2O75038 1416 aa24.28■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CNIH3-201ENST00000272133 IQGAP1P46940 1657 aa24.26■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 BCAR3O75815 825 aa24.26■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.26■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 SYNMO15061 1565 aa24.26■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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CNIH3-201ENST00000272133 MADDQ8WXG6 1647 aa24.25■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 APAF1O14727 1248 aa24.24■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.24■■□□□ 1.47
CNIH3-201ENST00000272133 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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CNIH3-201ENST00000272133 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.19■■□□□ 1.46
CNIH3-201ENST00000272133 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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CNIH3-201ENST00000272133 OSCARQ8IYS5 282 aa24.16■■□□□ 1.46
CNIH3-201ENST00000272133 USP19O94966 1318 aa24.16■■□□□ 1.46
CNIH3-201ENST00000272133 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.16■■□□□ 1.46
CNIH3-201ENST00000272133 E9PSI1 815 aa24.15■■□□□ 1.46
CNIH3-201ENST00000272133 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.15■■□□□ 1.46
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CNIH3-201ENST00000272133 SEC24BO95487 1268 aa24.12■■□□□ 1.45
CNIH3-201ENST00000272133 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.11■■□□□ 1.45
CNIH3-201ENST00000272133 PANK1Q8TE04 598 aa24.09■■□□□ 1.45
CNIH3-201ENST00000272133 COG6Q9Y2V7 657 aa24.09■■□□□ 1.45
CNIH3-201ENST00000272133 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.09■■□□□ 1.45
CNIH3-201ENST00000272133 TRPM2O94759 1503 aa24.09■■□□□ 1.45
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CNIH3-201ENST00000272133 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.05■■□□□ 1.44
CNIH3-201ENST00000272133 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.04■■□□□ 1.44
CNIH3-201ENST00000272133 WWC1Q8IX03 1113 aa24.03■■□□□ 1.44
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CNIH3-201ENST00000272133 NLRP1Q9C000 1473 aa24.02■■□□□ 1.44
CNIH3-201ENST00000272133 FANCAO15360 1455 aa24.02■■□□□ 1.44
CNIH3-201ENST00000272133 ERVK-7P63135 1459 aa24.02■■□□□ 1.44
CNIH3-201ENST00000272133 PTPRTO14522 1441 aa24.01■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 STAC3Q96MF2 364 aa24■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 NINLQ9Y2I6 1382 aa24■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.99■■□□□ 1.43
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CNIH3-201ENST00000272133 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.99■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 NEUROD2Q15784 382 aa23.99■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 BECN1Q14457 450 aa23.98■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 NGEFQ8N5V2 710 aa23.98■■□□□ 1.43
CNIH3-201ENST00000272133 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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CNIH3-201ENST00000272133 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.94■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 RLBP1P12271 317 aa23.94■■□□□ 1.42
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CNIH3-201ENST00000272133 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.93■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.93■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.92■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 ADGRL1O94910 1474 aa23.92■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 ABCA6Q8N139 1617 aa23.92■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.91■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.9■■□□□ 1.42
CNIH3-201ENST00000272133 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
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