RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 IQGAP2Q13576 1575 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHG5O94827 1062 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 KIF14Q15058 1648 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 TPM2P07951 284 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 RNF20Q5VTR2 975 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 ERC2O15083 957 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 TEFQ10587 303 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.63
PTPRB-201ENST00000261266 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 SOX12O15370 315 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 HIP1O00291 1037 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 TPM1P09493 284 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 NUCB2P80303 420 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 TPM3P06753 285 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF428Q96B54 188 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 PDE4AP27815 886 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 PSME1Q06323 249 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 G3V3G9 751 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 IL27Q8NEV9 243 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 H3BQV1 296 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 IFFO2Q5TF58 517 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 AKNAQ7Z591 1439 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 MCM2P49736 904 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM29Q14134 588 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ERC1Q8IUD2 1116 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 RIPK4P57078 832 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
PTPRB-201ENST00000261266 ERBINQ96RT1 1412 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 CRBNQ96SW2 442 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 APBB1O00213 710 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 GNAI3P08754 354 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 PDE3AQ14432 1141 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 EVA1CP58658 441 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 WDR63Q8IWG1 891 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 PSMA5P28066 241 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 GCC1Q96CN9 775 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 CDC45O75419 566 aa11□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11□□□□□ -0.65
PTPRB-201ENST00000261266 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11□□□□□ -0.65
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