RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 LILRB3O75022 631 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 SLC34A2O95436 690 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 RFX1P22670 979 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 CCDC27Q2M243 656 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 IER5LQ5T953 404 aa9.79□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 USP17L8P0C7I0 530 aa9.78□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 CD46P15529 392 aa9.78□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.78□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 AP1G2O75843 785 aa9.77□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.77□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.76□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 CERKQ8TCT0 537 aa9.76□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.75□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 GJA5P36382 358 aa9.75□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.75□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.75□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.75□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 JPH4Q96JJ6 628 aa9.74□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 WASHC4Q2M389 1173 aa9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 UNCXA6NJT0 531 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 PLCG2P16885 1265 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 NDUFV2P19404 249 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 UCN2Q96RP3 112 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 ALG2Q9H553 416 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.71□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.71□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 ATG7O95352 703 aa9.7□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.7□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 FOSBP53539 338 aa9.69□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 VAC14Q08AM6 782 aa9.69□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.69□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 RCCD1A6NED2 376 aa9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 PRSS12P56730 875 aa9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 EYA1Q99502 592 aa9.66□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.66□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.65□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 SULF1Q8IWU6 871 aa9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 PRR7Q8TB68 274 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 CDCA8Q53HL2 280 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 POTEHQ6S545 545 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.62□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.62□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 C3orf80F5H4A9 247 aa9.61□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.61□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.6□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 USP35Q9P2H5 1018 aa9.6□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 HOXA2O43364 376 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KDM4AO75164 1064 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 SOX11P35716 441 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 DNAJB2P25686 324 aa9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.56□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 FDX1P10109 184 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 TSKSQ9UJT2 592 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 POTEFA5A3E0 1075 aa9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 CLCN6P51797 869 aa9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.3 ms