RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.91■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.89■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 PLCH2O75038 1416 aa23.89■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.88■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.88■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 SLC24A1O60721 1099 aa23.87■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.87■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.87■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.86■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 COG6Q9Y2V7 657 aa23.86■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 E9PSI1 815 aa23.85■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 SLFN5Q08AF3 891 aa23.85■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.84■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.84■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 STAC3Q96MF2 364 aa23.84■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 STK26Q9P289 416 aa23.84■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 CFAP53Q96M91 514 aa23.83■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
LRP3-201ENST00000253193 FAM161AQ3B820 660 aa23.83■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 PANK1Q8TE04 598 aa23.81■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 PREX2Q70Z35 1606 aa23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.8■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.79■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.77■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.77■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
LRP3-201ENST00000253193 ABCC2Q92887 1545 aa23.76■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.76■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.74■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.73■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 MTHFSP49914 203 aa23.73■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.72■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.72■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.71■■□□□ 1.39
LRP3-201ENST00000253193 WWC1Q8IX03 1113 aa23.7■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.7■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 NFKBIBQ15653 356 aa23.68■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.68■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 FANCAO15360 1455 aa23.68■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 RUNDC1Q96C34 613 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 CABP2Q9NPB3 220 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 USP35Q9P2H5 1018 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 POGKQ9P215 609 aa23.67■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 ADGRL1O94910 1474 aa23.65■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 E9PCH4 1651 aa23.65■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 IGHDP01880 384 aa23.64■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 ARXQ96QS3 562 aa23.64■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.64■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 ATP10AO60312 1499 aa23.64■■□□□ 1.38
LRP3-201ENST00000253193 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.64■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.63■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 UNC13BO14795 1591 aa23.62■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.62■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.61■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 BECN1Q14457 450 aa23.61■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 NOS1P29475 1434 aa23.61■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 CHD1O14646 1710 aa23.61■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.6■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.6■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 GSE1Q14687 1217 aa23.6■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 EVC2Q86UK5 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 ZNF521Q96K83 1311 aa23.6■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 C8orf34Q49A92 452 aa23.59■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 PIK3C2GO75747 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 PDE3AQ14432 1141 aa23.59■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 RAPGEF3O95398 923 aa23.59■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 NGEFQ8N5V2 710 aa23.59■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 INSRP06213 1382 aa23.58■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.58■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LRP3-201ENST00000253193 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.57■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 PLXNC1O60486 1568 aa23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 TNNQ9UQP3 1299 aa23.56■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 ABCC1P33527 1531 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms